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PPIRef

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Zenodo2025-02-10 更新2026-05-26 收录
官方服务:

资源简介:

PPIRef is a dataset of 3D structures of protein-protein interfaces. See the GitHub repository for more details. ppi_6A.zip stores the PPIRef dataset: .pdb files with all 6A-distance interfaces from PDB as of Jan 2024. ppi_6A_stats.zip stores the statistics about the dataset. This includes the indexes for fast search with MMseqs2 and iDist, as well as a .csv file with some statistics for all interfaces.

PPIRef是一套包含蛋白质-蛋白质相互作用界面(protein-protein interfaces)三维结构的数据集,更多细节可参阅其GitHub仓库。 ppi_6A.zip 压缩包存储了PPIRef数据集:其中收录了截至2024年1月来自PDB(Protein Data Bank)的所有满足6埃距离阈值的蛋白质相互作用界面的.pdb格式文件。 ppi_6A_stats.zip 压缩包包含该数据集的统计信息,具体包括用于配合MMseqs2与iDist实现快速检索的索引文件,以及一份涵盖所有蛋白质相互作用界面统计数据的.csv格式文件。

提供机构:
Zenodo
创建时间:
2024-02-12
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