Evidence of Real-time RNA Repair Mechanism: Bidirectional ADAR/APOBEC-mediated base mutations and synonymous transitions in Measles virus genome
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== Version 5 (2026-04-06) ◆DescriptionThis dataset contains three discoveries that contradict conventional wisdom. The first is bidirectional ADAR/APOBEC-mediated base mutation. The second is a dataset in which RNA repair can be actually confirmed. The third reveals the essential function of codons. Codons are strongly involved in RNA repair function. This discovery overturns the conventional theory that codon function is redundancy for energy efficiency (cost), and instead reveals that it is "redundancy for data defense and self-repair." These findings were revealed through genetic analysis of measles vaccines. This is the dataset of that raw data. ◆Version HistoryI am releasing additional validation data sequentially. Since there are still many unknowns, the analysis is ongoing. Therefore, there is no version that combines all the datasets into a single file. To understand the overall picture, all datasets from Version 1 to Version 5 are necessary. Version 1 is the basic dataset. Versions 2, 3, 4, and 5 are supplementary data to Version 1. ◆Version 51) RNA repair was investigated in more detail. Genetic information of almost the entire measles vaccine Moraten was examined. This includes the N, H, PVC, M, F, and L sections. The results of this study and those of Version 1 were almost identical. Dataset files:i)Measles_IC323_Moraten_Comparison_All_sections_Mutations.png (image) ii)Measles_IC323_Moraten_Comparison_All_sections_Mutations.csv iii)Measles_IC323_Moraten_Comparison_All_sections_Mutations.xlsxAll-sections raw data, memo for Gene CDS, Codon AA table in ii)2)The table summarizes the number and rate of base mutations, error numbers and rates, and RNA correction numbers and rates observed in the N, H, PVC, M, F, and L sections of the measles vaccine gene. Mutations occur in approximately 7% of the total bases in each section. 70% of these mutations are corrected during protein synthesis. This is RNA correction. The RNA correction rate is approximately 5% of the total bases. The error rate is about half of that, less than 2%. Table image file:1) RNA_Repair_ration_En.png ★★ License: CC BY 4.0 (Data) and CC BY-ND 4.0 (Images) == 日本語の説明 == == Version 5 (2026-04-06)今までの常識に反する3つの発見に関するデータセットです。1つはBidirectional ADAR/APOBEC-mediated base mutationです。2つ目はRNA修復が実際の確認できるデータセットです。 3つ目はコドンの本質的な機能を明らかにした。コドンがRNA修復機能に強く関わる。 コドンの機能が従来のエネルギー効率(コスト)のための冗長性という定説を覆し、「データ防衛・自己修復の冗長性であるという発見です。 それらは麻疹ワクチンの遺伝子分析で判明しました。 その生データのデータセットです。 ◆Version ヒストリ追加の検証データを順次発表しています。未知なることが多いので、解析は現在も進行中です。 それで全てのデータセットを1本にまとめたVersionはありません。全体像の把握にはVersion1からVersion5の全てのデータセットが必要です。Version 1は基本のデータセットです。Version 2,3,4,5はVersion 1の補足データです。 ◆Version 5.01)RNAの修復をより詳しく調べた。麻疹ワクチン・モラテンのほぼ全域の遺伝情報を調べた。N,H,PVC、M,F,Lセクションです。Version1ではNとHだけでした。結果はVersion 1の結果とほぼ同じです。 データセット・ファイル:i)Measles_IC323_Moraten_Comparison_All_sections_Mutations.png (image) ii)Measles_IC323_Moraten_Comparison_All_sections_Mutations.csv iii)Measles_IC323_Moraten_Comparison_All_sections_Mutations.xlsxAll-sections row data, memo for Gene CDS, Codon AA table 2)麻疹ワクチン・モラテンの遺伝子で観察できるRNA修正率とエラー率の表です。 N,H,PVC、M,F,Lセクションの塩基変異率、エラー数、RNA修正率をまとめて表にしました。 各セクションの全塩基数のだいたい7%に変異が発生しています。その変異数の70%がタンパク質合成時修正されます。 全塩基数に対してはRNA修正率は大体5%です。エラー率はその半分くらいの2%以下です。 Table image ファイル:1)RNA_Repair_ration_En.png★★ License: CC BY 4.0 (Data) and CC BY-ND 4.0 (Images) 以上
== 版本5（2026-04-06） ◆ 数据集说明 本数据集包含三项颠覆传统认知的发现。其一为双向ADAR/APOBEC介导的碱基突变（bidirectional ADAR/APOBEC-mediated base mutation）；其二为可实证RNA修复（RNA repair）的数据集；其三则阐明了密码子（codon）的核心功能——密码子与RNA修复功能密切相关。该发现推翻了“密码子的功能是为提升能量效率（成本控制）而存在的冗余性”这一传统理论，转而揭示其本质为“用于数据防御与自我修复的冗余性”。上述发现均通过麻疹疫苗的基因分析所得，本数据集即为对应原始数据。 ◆ 版本更新历史 本研究团队将陆续发布补充验证数据。由于目前仍存在诸多未明确的问题，相关分析仍在进行中，因此目前尚无将所有数据集整合为单个文件的版本。若要全面了解本研究的全貌，需使用版本1至版本5的全部数据集：版本1为基础数据集，版本2、3、4、5均为版本1的补充数据。 ◆ 版本5 1) 本研究对RNA修复展开了更细致的调研，对莫拉滕（Moraten）株麻疹疫苗的几乎全部遗传信息进行了检测，涵盖N、H、PVC、M、F及L区段。此前版本1仅检测了N与H区段，本研究结果与版本1的结果基本一致。 数据集文件： i) Measles_IC323_Moraten_Comparison_All_sections_Mutations.png（图像文件） ii) Measles_IC323_Moraten_Comparison_All_sections_Mutations.csv iii) Measles_IC323_Moraten_Comparison_All_sections_Mutations.xlsx 其中文件ii)包含全区段原始数据、基因编码序列（Coding Sequence, CDS）备忘及密码子-氨基酸对照表。 2) 本表格汇总了莫拉滕株麻疹疫苗基因的N、H、PVC、M、F及L区段中观测到的碱基突变数量与比率、错误数量与比率以及RNA校正数量与比率。每个区段中约7%的总碱基会发生突变，其中70%的突变会在蛋白质合成过程中得到修复，此即为RNA校正。针对总碱基数的RNA校正率约为5%，错误率约为其一半，即不足2%。 表格图像文件： 1) RNA_Repair_ration_En.png ★★ 许可证：数据采用知识共享署名4.0协议（CC BY 4.0），图像采用知识共享署名-禁止演绎4.0协议（CC BY-ND 4.0）
