宫颈癌RNA修饰组学测序数据
收藏干细胞与再生医学数据中心2022-11-04 更新2024-03-06 收录
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http://data.iscr.ac.cn/Article?id=63636340907ddd0adee99ecd
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资源简介：
通过TRIzol（Invitrogen）试剂分离RNA，并用Dynabeads mRNA纯化试剂盒（Invitrogen）提取mRNA，mRNA 在IPP 缓冲液（150 mM NaCl、0.1%NP-40和10 mM Tris-HCl[pH7.4]）与用12 μg 抗m6A多克隆抗体（Synaptic Systems，202003）进行孵育，并在4°C下处理2小时进行打断。然后通过在4℃下与50μl Protein-A 微珠（Sigma，P9424）孵育2小时，之后用0.5 mg/ml N6甲基腺苷（BERRY&ASSOCIATES，PR3732）洗脱三次后用Trizol萃取。将剩余的RNA重新悬浮在上清中，并用TruSeq进行文库生成™ RNA样品制备试剂盒v2（Illumina，San Diego，CA，USA）。在配对读取模式下使用Novaseq对文库进行测序，产生长度为150bp的读取。
提供机构：
中国科学院北京基因组研究所
创建时间：
2022-11-04
