遇见数据集

Siwiec et al 2024 - RAW full microscopic images; DG PV-SOM-GFP staining in Htr7-GFP mice

收藏
Zenodo2024-10-11 更新2026-05-26 收录
官方服务:

资源简介:

The archive contains raw microscopic images in Zeiss (.czi) format obtained during the Siwiec 2024 study (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.17.613425v1). Datafiles contain Z-stacks of microscopic images with metadata and four image channels (immunostaining for parvalbumin, somatostatin and GFP, with DAPI nuclear counterstain; see describing work for technical details) of transverse hippocampal sections from transgenic Htr7-GFP mice Tg(Htr7-EGFP)ST29Gsat. Example open software supporting .czi files: FIJI, Bio-Formats, ZEISS libczi C++ library (github.com/ZEISS/libczi) and its implementations (e.g. aicspylibczi in Python).

本存档包含Siwiec 2024研究中获取的蔡司(Zeiss).czi格式原始显微图像(研究链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.17.613425v1)。数据文件包含带有元数据的显微图像Z轴堆叠序列,以及来自转基因Htr7-GFP小鼠Tg(Htr7-EGFP)ST29Gsat的海马横向切片的四个成像通道:分别为针对小白蛋白、生长抑素的免疫染色通道、GFP荧光标记通道以及DAPI细胞核复染通道;技术细节详见相关研究工作。支持.czi格式文件的开源软件示例包括:FIJI、Bio-Formats、蔡司ZEISS libczi C++库(仓库地址:github.com/ZEISS/libczi)及其衍生实现(如Python环境下的aicspylibczi工具包)。

提供机构:
Zenodo
创建时间:
2024-10-11
二维码
社区交流群
二维码
科研交流群
商业服务