200 ns simulation of a DMPC bilayer using Gromos 53A6 + Berger lipids

<strong>MD simulation of a DMPC bilayer: 200 ns </strong> Gromos 53A6 force field and Berger lipids (lipid.itp) 128 DMPC lipids and 3655 SPC waters. Total number of atoms: 16853. This simulation: 200 ns. The systems was equilibrated for 52 ns before this run. Simulation details: Temperature: 323 K Times step: 2 fs V-rescale thermostat, Parrinello-Rahman barostat, P-LINCS for constraints The run was done using a laptop with GTX980M. Performance: ~105ns/day Area per lipid and thickness (P-P distance) are provided.**二肉豆蔻酰磷脂酰胆碱（DMPC）双层膜的分子动力学（Molecular Dynamics, MD）模拟：时长200纳秒** 采用Gromos 53A6力场与Berger脂质参数模型（lipid.itp） 体系包含128个DMPC脂质分子与3655个单电荷（Single Point Charge, SPC）水分子，总原子数为16853。 本次模拟时长为200 ns，正式运行前已对该体系完成52纳秒的平衡模拟。 模拟参数细节： - 温度：323 K - 时间步长：2 fs - 控温采用V-rescale恒温器，控压采用Parrinello-Rahman压浴，约束求解使用P-LINCS算法 - 本次模拟运行于搭载GTX980M显卡的笔记本电脑，模拟性能约为105 ns/天 本数据集已提供单位脂质面积与膜厚度（磷-磷间距）的相关数据。