Simulation CER160_128_POPC_512_NaCl_150mM_310K_rep1 membrane

<strong>Title publication:</strong> <em>A Ceramide-Regulated Element in the Late Endosomal Protein LAPTM4B Controls Amino Acid Transporter Interaction</em> <strong>Year publication:</strong> 2018 <strong>DOI publication: </strong>10.1021/acscentsci.7b00582 <strong>Description:</strong> Simulation 512 POPCs membrane containing 128 ceramides (CER160) using charmm36 at 310K. <strong>MD engine:</strong> gromacs 2016.1 <strong>Force field</strong>: charmm36 <strong>Temperature</strong>: 310 K <strong>Pressure:</strong> 1 bar <strong>Simulation time</strong>: 3000 ns <strong>Saving frequency</strong>: 100 ps <strong>Molecular content</strong>: POPC 512<br> CER160 128<br> SOL 32000<br> NA 86<br> CL 86 <strong>Additional </strong><strong>information</strong>:**发表标题：** *晚期内体蛋白LAPTM4B中受神经酰胺（Ceramide）调控的元件调控氨基酸转运体的相互作用* **发表年份：** 2018 **发表DOI：** 10.1021/acscentsci.7b00582 **数据集描述：** 采用CHARMM36力场，于310K下对包含512个POPC分子与128个CER160型神经酰胺的膜体系开展分子动力学模拟 **分子动力学模拟引擎：** GROMACS 2016.1 **力场：** CHARMM36 **模拟温度：** 310 K **模拟压力：** 1 巴 **模拟时长：** 3000 ns **数据保存频率：** 100 ps **分子组成：** POPC：512个 CER160：128个 溶剂分子（SOL）：32000个 钠离子（Na⁺）：86个 氯离子（Cl⁻）：86个 **附加信息：** 无