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Differentiation of human monocytes into macrophages (RNA-seq, Salmon 1.4.0, GENCODE 36)

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Zenodo2021-02-01 更新2026-05-25 收录
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RNA-seq of differentiation of human monocytes into macrophages as described in: Phanstiel et al "Static and Dynamic DNA Loops form AP-1-Bound Activation Hubs during Macrophage Development" Molecular Cell, Volume 67, Issue 6, 2017, Pages 1037-1048.e6. https://doi.org/10.1016/j.molcel.2017.08.006 See publication for full author list. Data from publication was reprocessed by Michael Love. Paired end reads were quantified with Salmon 1.4.0 and GENCODE 36 human transcripts.

本数据集聚焦人类单核细胞向巨噬细胞分化过程的RNA测序(RNA-seq)数据。相关研究详见:Phanstiel等人发表于《分子细胞(*Molecular Cell*)》2017年第67卷第6期,页码1037-1048.e6的论文《巨噬细胞发育过程中静态与动态DNA环形成结合激活蛋白1(AP-1)的激活枢纽》,DOI链接:https://doi.org/10.1016/j.molcel.2017.08.006。完整作者列表请参阅该原始研究论文。该论文的原始数据由Michael Love完成重新处理。本研究使用Salmon 1.4.0软件,并以GENCODE 36人类转录本注释数据库作为参考序列,对双端测序读段进行了定量分析。

提供机构:
Zenodo
创建时间:
2021-02-01
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