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Generation of a mitochondrial protein compendium in Dictyostelium discoideum

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Mendeley Data2026-04-18 收录
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The data file contains 10 original microscopy image files, Related to Figure 3, and 10 excel files (Supplemental Tables 1-10). Supplemental Table descriptions: Table S1. D. discoideum homologs of human mitochondrial proteins, Related to Figure 1. Table S2. Proteomic discovery relative enrichments and relative enrichment ratios, Related to Figure 1. Table S3. Proteomic discovery core mitochondrial proteins, Related to Figure 2. Table S4. Predicted probabilities of mitochondrial localization based on GMM, Related to Figure 2. Table S5. Proteomic discovery mitochondrial targeting sequence prediction, Related to Figure 2. Table S6. Microscopy validation of relative enrichment ratio cutoff, Related to Figure 3. Table S7. Classifications of the mitochondrial protein compendium, Related to Tables 1 and 2. Table S8. All ribosomal proteins in the mitochondrial protein compendium, Related to Table 2. Table S9. Expression profiles for genes encoding mitochondrial proteins, Related to Figure 4. Table S10. List of oligos used for cloning, Related to Figure 3.

本数据文件包含10份原始显微图像文件(与图3相关),以及10份Excel文件(补充表1至10)。 补充表说明: 表S1. 人类线粒体蛋白的盘基网柄菌(Dictyostelium discoideum)同源蛋白,与图1相关。 表S2. 蛋白质组学发现的相对富集度及相对富集比,与图1相关。 表S3. 蛋白质组学发现的核心线粒体蛋白,与图2相关。 表S4. 基于高斯混合模型(Gaussian Mixture Model, GMM)的线粒体定位预测概率,与图2相关。 表S5. 蛋白质组学发现的线粒体靶向序列预测结果,与图2相关。 表S6. 相对富集比截值的显微镜验证,与图3相关。 表S7. 线粒体蛋白组目录的分类信息,与表1、表2相关。 表S8. 线粒体蛋白组目录中的全部核糖体蛋白,与表2相关。 表S9. 线粒体蛋白编码基因的表达谱,与图4相关。 表S10. 克隆所用寡核苷酸引物列表,与图3相关。
创建时间:
2022-04-27
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