MTBC_fastq

20 WGS of representatives of the <em>Mycobacterium tuberculosis</em> complex. Names on the files are the same as the run accession number. Metadata associated can thus be obtained from NCBI or EBI using the respective accession number. The lineages represented are: ERR181435 M. tuberculosis L7<br> ERR2659153 M.orygis La3<br> SRR998584 M. africanum L5<br> ERR1203059 M. africanum L5<br> ERR551620 M. africanum L5;M. tuberculosis L2 (mixed)<br> ERR2704687 M. africanum L6<br> ERR2704678 M. tuberculosis L3<br> ERR2704679 M. tuberculosis L1<br> ERR6362653 M. tuberculosis L2<br> ERR6362484 M. tuberculosis L4<br> ERR313115 M.canettii<br> ERR6362648 M. tuberculosis L2<br> ERR6362964 M. tuberculosis L2<br> ERR6362139 M. tuberculosis L4<br> ERR5987352 M. tuberculosis L4<br> ERR6362321 M. tuberculosis L2<br> ERR6361964 M. tuberculosis L2<br> ERR6362333 M. tuberculosis L2<br> ERR6052057 M. tuberculosis L2<br> SRR13046689 M. bovis La1

本数据集收录20株结核分枝杆菌复合群（*Mycobacterium tuberculosis* complex）代表菌株的全基因组测序（Whole Genome Sequencing, WGS）数据。各文件的名称与对应的测序运行登录号（run accession number）完全一致，因此可通过对应登录号从NCBI或EBI获取相关元数据（metadata）。本数据集涵盖的谱系如下：
ERR181435：结核分枝杆菌（*M. tuberculosis*）L7型
ERR2659153：羊分枝杆菌（*M. orygis*）La3型
SRR998584：非洲分枝杆菌（*M. africanum*）L5型
ERR1203059：非洲分枝杆菌（*M. africanum*）L5型
ERR551620：非洲分枝杆菌（*M. africanum*）L5型；结核分枝杆菌（*M. tuberculosis*）L2型（混合样本）
ERR2704687：非洲分枝杆菌（*M. africanum*）L6型
ERR2704678：结核分枝杆菌（*M. tuberculosis*）L3型
ERR2704679：结核分枝杆菌（*M. tuberculosis*）L1型
ERR6362653：结核分枝杆菌（*M. tuberculosis*）L2型
ERR6362484：结核分枝杆菌（*M. tuberculosis*）L4型
ERR313115：卡氏分枝杆菌（*M. canettii*）
ERR6362648：结核分枝杆菌（*M. tuberculosis*）L2型
ERR6362964：结核分枝杆菌（*M. tuberculosis*）L2型
ERR6362139：结核分枝杆菌（*M. tuberculosis*）L4型
ERR5987352：结核分枝杆菌（*M. tuberculosis*）L4型
ERR6362321：结核分枝杆菌（*M. tuberculosis*）L2型
ERR6361964：结核分枝杆菌（*M. tuberculosis*）L2型
ERR6362333：结核分枝杆菌（*M. tuberculosis*）L2型
ERR6052057：结核分枝杆菌（*M. tuberculosis*）L2型
SRR13046689：牛分枝杆菌（*M. bovis*）La1型