songlab/hg38_cactus447way

Name: songlab/hg38_cactus447way
Creator: songlab
Published: 2025-09-12 23:26:12
License: 暂无描述

Hugging Face2025-09-12 更新2025-10-18 收录

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songlab

songlab/hg38-variant-consequences

该数据集提供了人类基因组(GRCh38/hg38)中所有可能的单核苷酸变异(SNVs)的预计算VEP后果，并附有ENCODE SCREEN的顺式调控元件(CRE)注释。对于非外显子变异(如基因间、内含子、基因上游/下游变异)，数据集中的`consequence_cre`列包含了基于与顺式调控元件重叠的CRE类别。数据集还包括了VEP容器和标志的详细信息、CRE注释的分类和优先级规则、数据模式描述、

Hugging Face2026-01-28 更新60

songlab/gpn-msa-hg38-gene-essentiality-scores

GPN-MSA人类基因组基因必需性评分数据集，包含人类基因组中各个基因的必需性评分信息，用于研究基因变异对基因功能的影响。

Hugging Face2025-01-02 更新50

GRCh38_hg38

GRCh38 Genome Reference Consortium Human Build 38 Organism: Homo sapiens (human)

kaggle2021-09-07 更新130

songlab/gpn-msa-hg38-scores

该数据集包含了人类基因组中所有可能的单核苷酸多态性（SNPs）的GPN-MSA预测分数，大约有90亿个预测。这些预测分数可以帮助研究人员了解不同SNPs对基因功能的影响。

Hugging Face2025-01-02 更新450

songlab/multiz100way

该数据集包含100个脊椎动物的经过处理的完整基因组比对信息。数据集以两种格式提供，分别为89.zarr.zip和99.zarr.zip，包含人类基因组序列以及来自89个或99个脊椎动物的序列。源数据来自UCSC基因组浏览器和Ensembl。该数据集用于变异效果预测（VEP）等任务，并与gpn.data模块中的GenomeMSA类兼容。数据可以通过流式传输或本地下载方式访问，后者由于查询速度快且支持

Hugging Face2025-01-02 更新1060