pVAE_datasets

Recount3 mice data. Curated recount3 gene expression data : no_scrna_rpkm.ftr, pathways data: extended_plier_pathways.tsv, plier_pathways_processed.tsv , gene length: gene_lengths.tsv. We have plier model: plier.rds for comparison. plier.rds - Plier Model no_scrna_rpkm.ftr - Gene expression data used to train Plier model extended_plier_pathways.tsv - Pathways with gene ids plier_pathways_processed.tsv - Processed pathways with gene symbols gene_lengths.tsv - It contains information about length of the genes.Recount3小鼠数据集。本数据集包含经整理的Recount3基因表达数据文件no_scrna_rpkm.ftr，配套通路数据集包括extended_plier_pathways.tsv与plier_pathways_processed.tsv，另有基因长度数据集gene_lengths.tsv。 本数据集附带用于对比分析的Plier（plier）模型文件plier.rds。 各文件详情如下： - plier.rds：Plier模型 - no_scrna_rpkm.ftr：用于训练Plier模型的基因表达数据 - extended_plier_pathways.tsv：包含基因ID的通路数据集 - plier_pathways_processed.tsv：经基因符号标注的预处理通路数据集 - gene_lengths.tsv：收录基因长度相关信息的数据集