Regionalpcs ROSMAP Fine-mapped QTLs
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This dataset contains DAP-G fine-mapped QTL results for the following study: "regionalpcs improve discovery of DNA methylation associations with complex traits" Tiffany Eulalio*1, Min Woo Sun1, Olivier Gevaert1, Michael D. Greicius2, Thomas J. Montine3, Daniel Nachun*‡3, Stephen B. Montgomery*‡1,3 ‡ These authors contributed equally as senior authors * Corresponding authors: Tiffany Eulalio (eulalio@alumn.stanford.edu), Daniel Nachun (dnachun@stanford.edu), Stephen B. Montgomery (smontgom@stanford.edu) Author affiliations: 1. Department of Biomedical Data Science, Stanford University, Stanford, CA 2. Department of Neurology & Neurological Sciences, Stanford University, Stanford, CA 3. Department of Pathology, Stanford University, Stanford, CA Dataset description: The DAP-G results are organized by region type (full gene, gene body, preTSS, and promoters), cell type (astrocytes, endothelial cells, neurons, oligodendrocytes, and bulk), and summary type (averages and regionalpcs).
本数据集包含针对下述研究的DAP-G精细定位数量性状位点（Quantitative Trait Locus, QTL）结果： 《区域主成分分析提升复杂性状DNA甲基化关联研究的发掘效能》 Tiffany Eulalio*1, Min Woo Sun1, Olivier Gevaert1, Michael D. Greicius2, Thomas J. Montine3, Daniel Nachun*‡3, Stephen B. Montgomery*‡1,3 ‡ 上述作者为均等贡献的资深作者 * 通讯作者：Tiffany Eulalio（邮箱：eulalio@alumn.stanford.edu）、Daniel Nachun（邮箱：dnachun@stanford.edu）、Stephen B. Montgomery（邮箱：smontgom@stanford.edu） 作者单位： 1. 斯坦福大学生物医学数据科学系，美国加利福尼亚州斯坦福市 2. 斯坦福大学神经病学与神经科学系，美国加利福尼亚州斯坦福市 3. 斯坦福大学病理学系，美国加利福尼亚州斯坦福市 数据集说明： 本数据集的DAP-G结果按区域类型（全基因区、基因本体区、转录起始位点上游区（preTSS）及启动子区）、细胞类型（星形胶质细胞、内皮细胞、神经元、少突胶质细胞及整体组织）以及汇总类型（平均值及区域主成分（regionalpcs））进行组织。
