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Genomic validation of IRF3 antagonism by ORF4a, ORF4b, ORF5, and M in 272 human MERS-CoV isolates

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Zenodo2025-11-04 更新2026-05-26 收录
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资源简介:

This dataset provides a comprehensive genomic analysis of 272 human-derived MERS-CoV genomes, focused on the four interferon antagonists ORF4a, ORF4b, ORF5, and M identified by Yang et al. (Protein & Cell, 2013) as suppressors of IRF3 nuclear translocation and IFN-β production. For each isolate, the repository includes: Gene-specific variant calls (SNPs, in-frame and frameshift deletions)Protein-altering mutation statusQC metrics (gaps, Ns, protein length)Epidemiological metadata (country, year, location)Global and gene-specific summary statisticsPublication-ready, colorblind-safe visualizations This dataset empirically supports the functional role of all four proteins as IRF3 antagonists, demonstrating universal protein-altering variation and strong evolutionary constraint consistent with their non-redundant roles in immune evasion. Associated analysis files are included for full reproducibility.

本数据集针对272株人源中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)基因组开展了全面的基因组分析,重点聚焦Yang等人于2013年发表于《Protein & Cell》的研究中所鉴定的四种干扰素拮抗剂(interferon antagonists):ORF4a、ORF4b、ORF5以及M蛋白,上述蛋白被证实可抑制干扰素调节因子3(IRF3)核转位与干扰素-β(IFN-β)的产生。 针对每一株分离株,本数据集仓库包含以下内容: 1. 基因特异性变异检测结果(单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs)、框内缺失与移码缺失); 2. 蛋白质序列改变型突变状态; 3. 质量控制(Quality Control, QC)指标(序列缺口、模糊碱基N、蛋白质长度); 4. 流行病学元数据(采集国家、年份、采样地点); 5. 全基因组及基因特异性汇总统计数据; 6. 可直接用于学术发表、适配色弱人群的可视化图表。 本数据集通过实验验证了上述四种蛋白作为IRF3拮抗剂的功能角色,证实其普遍存在蛋白质序列改变型变异,且呈现较强的进化约束特征,这与其在免疫逃逸过程中发挥的非冗余功能相一致。 本数据集附带完整的配套分析文件,以保障研究结果可完全复现。

提供机构:
Zenodo
创建时间:
2025-11-04
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