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S75 | CyanoMetDB | Comprehensive database of secondary metabolites from cyanobacteria

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Zenodo2025-12-04 更新2026-05-26 收录
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资源简介:

CyanoMetDB is a comprehensive database of secondary metabolites from cyanobacteria manually curated from primary references described in Jones et al (2021), DOI: 10.1016/j.watres.2021.117017. Latest update: Sept. 2024 (V03). Dataset DOI: 10.5281/zenodo.4551528. CyanoMetDB is a comprehensive database of secondary metabolites from cyanobacteria manually curated from primary references described in Jones et al (2021), DOI: 10.1016/j.watres.2021.117017 (preprint DOI: 10.1101/2020.04.16.038703). This upload contains the 2024 release. Please cite Jones et al (2021) DOI: 10.1016/j.watres.2021.117017 and this record Janssen et al (2024) DOI: 10.5281/zenodo.13854577 when using this CyanoMetDB Version 3! Contents: CyanoMetDB XLSX database (2024 release): CyanoMetDB_Version03.xlsx Additional files for workflows: CSV format: CyanoMetDB_V03_2024.csvMetFrag local CSV file (original database abridged and reformatted for use in MetFrag): CyanoMetDB_V03_2024_MetFrag.csv Additional files for matching InChIKeys (rapid suspect flagging): CyanoMetDB_V03_2024_InChIKeys.txt Corresponding author: Elisabeth Janssen (Eawag): Elisabeth.Janssen@eawag.ch

CyanoMetDB是一款收录蓝藻次生代谢物的综合性数据库,其数据均由人工从Jones等人2021年发表的原始文献中审校遴选而来,原始文献DOI:10.1016/j.watres.2021.117017。该数据库最新更新时间为2024年9月(版本V03),数据集DOI:10.5281/zenodo.4551528。 CyanoMetDB是一款收录蓝藻次生代谢物的综合性数据库,其数据均由人工从Jones等人2021年发表的原始文献(预印本DOI:10.1101/2020.04.16.038703)中审校遴选所得。本次上传为2024版数据集。使用该V3版CyanoMetDB时,请同时引用Jones等人2021年的文献(DOI: 10.1016/j.watres.2021.117017)以及本数据集记录Janssen等人2024年的文献(DOI: 10.5281/zenodo.13854577)。 数据集内容: 1. 2024版CyanoMetDB XLSX格式数据库:CyanoMetDB_Version03.xlsx 2. 分析流程配套附加文件: - CSV格式文件:CyanoMetDB_V03_2024.csv - 适配MetFrag工具的本地CSV文件(对原始数据库进行精简与重格式化以适配MetFrag使用):CyanoMetDB_V03_2024_MetFrag.csv - 用于匹配InChIKeys(快速嫌疑化合物标记)的附加文件:CyanoMetDB_V03_2024_InChIKeys.txt 通讯作者:伊丽莎白·扬森(Eawag),联系邮箱:Elisabeth.Janssen@eawag.ch

提供机构:
Zenodo
创建时间:
2024-09-28
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