TABLE 1 in Morphology and multigene phylogeny reveal a novel Stagonospora species (Massarinaceae, Dothideomycetes) from Thailand
收藏资源简介:
TABLE 1. The amplified loci, primers, and PCR thermal cycle protocols were used in this study. Genes/lociPCR primers (forward/reverse) PCR conditionsReferenceLSULR0R/LR595 °C; 5 min (94 °C; 30 s, 55 °C; 50 s, 72 °C; 90 s) × 35 thermal cycles, 72 °C; 10 minVilgalys & Hester (1990)ITS SSUITS1 / ITS4 NS1 / NS494 °C; 2 min (95 °C; 30 s, 55 °C; 50 s, 72 °C; 90 s) × 35 thermal cycles, 72 °C; 10 minWhite et al. (1990)tef 1-αEF1-983F / EF1-2218R95 °C; 5 min (95 °C; 30 s, 58 °C; 50 s, 72 °C; 1 min) Rehner & Buckley (2005) × 35 thermal cycles, 72 °C; 10 min
表1 本研究使用的扩增位点、PCR引物(正向/反向)及聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)热循环程序如下: 1. 基因/位点:LSU;正向/反向引物:LR0R/LR5;PCR反应程序:95℃ 预变性5 min,(94℃ 变性30 s、55℃ 退火50 s、72℃ 延伸90 s)循环35次,72℃ 终延伸10 min;参考文献:Vilgalys & Hester (1990) 2. 基因/位点:ITS、SSU;正向/反向引物:ITS1/ITS4、NS1/NS4;PCR反应程序:94℃ 预变性2 min,(95℃ 变性30 s、55℃ 退火50 s、72℃ 延伸90 s)循环35次,72℃ 终延伸10 min;参考文献:White et al. (1990) 3. 基因/位点:tef 1-α;正向/反向引物:EF1-983F/EF1-2218R;PCR反应程序:95℃ 预变性5 min,(95℃ 变性30 s、58℃ 退火50 s、72℃ 延伸1 min)循环35次,72℃ 终延伸10 min;参考文献:Rehner & Buckley (2005)



