HpTonB(30-285) simulation Amber ff99SB-ILDN
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Simulation of periplasmic part of TonB protein from <em>Helicobacter Pylori</em> HpTonB(30-285) with Amber ff99SB-ILDN force field. Trajectory contains the whole 387ns simulation. The conformational ensemble is too collapsed here according to the comparison with experimental spin relaxation data.
采用Amber ff99SB-ILDN力场，对幽门螺杆菌（Helicobacter pylori）来源的TonB蛋白周质部分HpTonB(30-285)进行模拟。该轨迹涵盖了完整的387纳秒模拟过程。经与实验自旋弛豫数据对比后发现，此构象系综存在过度坍缩的问题。
提供机构：
Zenodo创建时间：
2020-04-16
