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Database files for Cenote-Taker 3

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Zenodo2024-07-10 更新2026-05-26 收录
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资源简介:

hmmscan_DBs.tgz = tarball of compiled HMM databases (h3m files) (updated for v3.1.1) refseq_virus_prot.fasta.gz = refseq virus protein seqs for mmseqs2 tax database refseq_virus_prot_taxids.mmseqs_fmt.tsv = tax info required for mmseqs2 tax database annotation cddid_all.tbl = CDD functional annotation table viral_cdds_and_pfams_191028.txt = list of domain accessions commonly found in virus genomes

hmmscan_DBs.tgz:已编译的隐马尔可夫模型(Hidden Markov Model, HMM)数据库压缩包(包含h3m格式文件,适配v3.1.1版本更新) refseq_virus_prot.fasta.gz:用于MMseqs2分类数据库的参考序列(RefSeq)病毒蛋白质序列文件 refseq_virus_prot_taxids.mmseqs_fmt.tsv:MMseqs2分类数据库注释所需的分类学信息文件 cddid_all.tbl:保守结构域数据库(Conserved Domain Database, CDD)功能注释表 viral_cdds_and_pfams_191028.txt:病毒基因组中常见的保守结构域数据库(CDD)与蛋白质家族数据库(Pfam)结构域登录号列表

提供机构:
Zenodo
创建时间:
2024-01-10
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