Table 1. A in Molecular phylogenetics and taxonomic reassessment of the widespread agamid lizard Calotes versicolor (Daudin, 1802) (Squamata, Agamidae) across South Asia
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Table 1. A summary of the models of sequence evolution used for each partition in the ML and BI molecular phylogenetic analyses. *COI 2nd was combined with 16S in BI, as per the output of PartitionFinder analysis. PartitionCodon positionModelMLBI116STPM+F+I+G4HKY+I2COI 1stTN+F+G4GTR+G3*COI 2ndTIM3e+G4-4COI 3rdF81+FF81
表1 最大似然法(ML,Maximum Likelihood)与贝叶斯推断法(BI,Bayesian Inference)的分子系统发育分析中各序列分区所用演化模型汇总。注:根据PartitionFinder(分区查找器)分析结果,在BI分析中,带星号的细胞色素C氧化酶亚基I(COI)第二密码子位置序列与16S序列合并。 | 分区编号 | 密码子位置 | 演化模型 | ML分析模型 | BI分析模型 | | :---: | :---: | :---: | :---: | :---: | | 1 | 16S | TPM+F+I+G4 | HKY+I | - | 2 | COI 第一密码子位置 | TN+F+G4 | GTR+G | - | 3 | *COI 第二密码子位置 | TIM3e+G4 | - | - | 4 | COI 第三密码子位置 | F81+F | F81 | F81
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2025-04-04



