MS-based DDA and DIA datasets for the MsDataHub package
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`vanPuyvelde_2022_LFQ_*`: DDA and DIA data from van Puyvelde et al. (2022) - LFQ benchmarking experiment processed with different software. `Christoforou_2016_TMT_DDA_*`: data from Christoforou et al. (2016) - hyperLOPIT spatial proteomics experiment processed with different software. `Derks_2022_plex_DIA_DIANN_report_subset.tsv`: subset from Derks et al. (2022) plexDIA data.
`vanPuyvelde_2022_LFQ_*`: 该数据集源自van Puyvelde等人2022年的研究,包含经不同软件处理的无标记定量(Label-Free Quantification, LFQ)基准测试实验所产生的数据依赖性采集(Data-Dependent Acquisition, DDA)与数据非依赖性采集(Data-Independent Acquisition, DIA)数据。 `Christoforou_2016_TMT_DDA_*`: 该数据集源自Christoforou等人2016年的研究,为经不同软件处理的超分层空间蛋白质组学(hyperLOPIT)实验数据,该实验采用了串联质量标签(Tandem Mass Tag, TMT)标记与数据依赖性采集(DDA)策略。 `Derks_2022_plex_DIA_DIANN_report_subset.tsv`: 该文件为Derks等人2022年研究中plexDIA数据集的子集,对应经DIA-NN(DIANN)软件生成的报告子集。



