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Vertebrates species trees

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Figshare2023-05-03 更新2026-04-08 收录
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资源简介:

Vertebrate complete phylogenetic tree (Vertebrate_consensus_tree_nodelabel.nwk) and the same tree but pruned retaining only species with at-least 80% complete BUSCO genes (BUSCO80_vertebrate_tree.nwk) or with at-least 90% complete BUSCO genes (BUSCO90_vertebrate_tree.nwk) <br>

本数据集包含两类系统发育树:其一为脊椎动物完整系统发育树,文件名为Vertebrate_consensus_tree_nodelabel.nwk;其二为基于该完整树修剪得到的同源树,其中一棵仅保留至少80%完整通用单拷贝同源基因基准集(Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs,BUSCO)基因的物种,对应文件为BUSCO80_vertebrate_tree.nwk,另一棵仅保留至少90%完整BUSCO基因的物种,对应文件为BUSCO90_vertebrate_tree.nwk。

提供机构:
Policarpo, Maxime
创建时间:
2023-05-03
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