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Syzygium syzygioides genome assembly and annotation

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Zenodo2025-02-05 更新2026-05-26 收录
官方服务:

资源简介:

De novo genome assembly and annotation of Syzygium syzygioides. The following files are available: ssyz.fa.gz: reference genome sequence in fasta format ssyz.gff3.gz: gene annotation in GFF3 format ssyz.gtf.gz: gene annotation in GTF format ssyz.tx.fa.gz: transcript sequences in fasta format ssyz.cds.fa.gz: coding sequences in fasta format ssyz.prot.fa.gz: protein sequences in fasta format ssyz.tsv.gz: gene functional annotation in TSV format ssyz.chr_to_id.tsv.gz: mapping of sequence names to ids in TSV format

本数据集包含赤楠(Syzygium syzygioides)的从头基因组组装与注释结果。 本次可获取的文件如下: ssyz.fa.gz:FASTA格式参考基因组序列文件 ssyz.gff3.gz:GFF3格式基因注释文件 ssyz.gtf.gz:GTF格式基因注释文件 ssyz.tx.fa.gz:FASTA格式转录本序列文件 ssyz.cds.fa.gz:FASTA格式编码序列(CDS)文件 ssyz.prot.fa.gz:FASTA格式蛋白质序列文件 ssyz.tsv.gz:TSV格式基因功能注释文件 ssyz.chr_to_id.tsv.gz:TSV格式序列名称与标识符映射文件

提供机构:
Zenodo
创建时间:
2025-02-05
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