Dataset: Coral high molecular weight carbohydrates support opportunistic microbes in bacterioplankton from an algae-dominated reef

This dataset contains raw data for figures 5 (genus-level microbial community compositions) and 6 (predicted metabolic functions, pathway types), R code for PERMANOVAs (Table 3), DESeq2 and random forest (rfpermute) analyses, and R code to generate figures 5, 6b, S5 & S6. Overview of .txt files: Genus_16S_Counts.txt Counts data used for DESeq2 analysis (Fig. 5c). Genus_16S_relAbund.txt Relative abundance data used for Fig. 5a, b & d. MicFunPred_MetaCyc_types_all Predicted pathway abundance data for all pathway types used for DESeq2 (Fig. 6b), PERMANOVA (Table 3) and column clustering of Fig. 6b. MicFunPred_MetaCyc_AA_types.txt Amino acids (Fig. 6b) MicFunPred_MetaCyc_CH_types.txt Carbohydrates (Fig. 6b) MicFunPred_MetaCyc_EM _types.txt Energy metabolism (Fig. 6b) MicFunPred_MetaCyc_FAL _types.txt Fatty acids and lipids (Fig. 6b) MicFunPred_MetaCyc_SM _types.txt Secondary metabolism (Fig. 6b) MicFunPred_MetaCyc_OBiosyn _types.txt Other biosynthesis (Fig. S6) MicFunPred_MetaCyc_ODeg _types.txt Other degradation (Fig. S6)本数据集包含用于生成图5（属级微生物群落组成）与图6（预测代谢功能、通路类型）的原始数据、用于置换多变量方差分析（PERMANOVA，对应表3）、DESeq2与随机森林（rfpermute）分析的R代码，以及用于绘制图5、图6b、补充图S5与S6的R代码。 .txt 文件概览： Genus_16S_Counts.txt：用于DESeq2分析（图5c）的计数数据。 Genus_16S_relAbund.txt：用于图5a、5b与5d的相对丰度数据。 MicFunPred_MetaCyc_types_all：用于DESeq2分析（图6b）、PERMANOVA（对应表3）及图6b列聚类的所有通路类型的预测通路丰度数据。 MicFunPred_MetaCyc_AA_types.txt：氨基酸相关数据（对应图6b） MicFunPred_MetaCyc_CH_types.txt：碳水化合物相关数据（对应图6b） MicFunPred_MetaCyc_EM_types.txt：能量代谢相关数据（对应图6b） MicFunPred_MetaCyc_FAL_types.txt：脂肪酸与脂质相关数据（对应图6b） MicFunPred_MetaCyc_SM_types.txt：次级代谢相关数据（对应图6b） MicFunPred_MetaCyc_OBiosyn_types.txt：其他生物合成相关数据（对应补充图S6） MicFunPred_MetaCyc_ODeg_types.txt：其他降解相关数据（对应补充图S6）