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scRNA-seq of 5 cell lines using 10x v3 kit

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Figshare2019-07-27 更新2026-04-08 收录
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scRNA-seq of 5 lung cancer cell lines (A549, H838, HCC827, H1975, H2228) using 10x v3 kit. previous study: https://www.nature.com/articles/s41592-019-0425-8<br>scRNA-seq data processed by cellranger (3.0.2). scATAC-seq data processed by cellranger-atac (1.0.1). All with default parameters.<br>scATAC-seq sequenced for the same batch: https://doi.org/10.26188/5d3b9b0bbbc4d

采用10x Genomics V3试剂盒对5株肺癌细胞系(A549、H838、HCC827、H1975、H2228)开展单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)。相关前期研究:https://www.nature.com/articles/s41592-019-0425-8 单细胞RNA测序数据通过Cell Ranger(3.0.2版本)处理;单细胞转座酶可及性测序(single-cell assay for transposase-accessible chromatin sequencing, scATAC-seq)数据则通过Cell Ranger ATAC(1.0.1版本)完成处理,所有分析均采用默认参数。 同批次测序的单细胞转座酶可及性测序数据:https://doi.org/10.26188/5d3b9b0bbbc4d

创建时间:
2019-07-27
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