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R package for PanRTK mechanistic signaling model

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Figshare2017-08-23 更新2026-04-08 收录
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资源简介:

Signaling pathway model comprised of ODEs describing receptor dimerization and activation of MAPK and PI3K pathways.Data for seven individual cell lines are linked therein.The code is written for the open-source R framework dMod (https://github.com/dkaschek/dMod).<br>The corresponding paper is available at BioRxiv (http://www.biorxiv.org/content/early/2017/05/27/142901) and in press at npj Systems Biology and Applications.<br>

本数据集包含由常微分方程(Ordinary Differential Equations, ODEs)构建的信号通路模型,该模型用于描述受体二聚化以及丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase, MAPK)、磷脂酰肌醇3-激酶(Phosphoinositide 3-kinase, PI3K)通路的激活过程。其中关联了7种独立细胞系的实验数据。本代码针对开源R语言框架dMod编写,相关链接:https://github.com/dkaschek/dMod。 相关研究论文可在预印本平台BioRxiv查阅,链接为http://www.biorxiv.org/content/early/2017/05/27/142901,同时该论文已被《npj系统生物学与应用》(npj Systems Biology and Applications)期刊接收待刊。

创建时间:
2017-08-23
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