ImmuneRegulation

ImmuneRegulation, that enables users to interactively explore immune regulatory elements that drive cell-type or cohort-specific gene expression levels. ImmuneRegulation currently provides the largest centrally integrated resource on human transcriptome regulation across whole blood and blood cell types, including (i) ∼43,000 genotyped individuals with associated gene expression data from ∼51,000 experiments, yielding genetic variant-gene expression associations on ∼220 million eQTLs; (ii) 14 million transcription factor (TF)-binding region hits extracted from 1945 ChIP-seq studies; and (iii) the latest GWAS catalog with 67,230 published variant-trait associations.免疫调控数据库（ImmuneRegulation）可支持用户交互式探索驱动细胞类型或队列特异性基因表达水平的免疫调控元件。该数据库是目前全球规模最大的针对全血及各类血细胞的人类转录组调控集中整合资源，涵盖以下三类数据：(i) 约4.3万名基因分型个体的配套基因表达数据（源自约5.1万个实验），由此得到约2.2亿个表达数量性状位点（expression quantitative trait locus, eQTL）上的遗传变异-基因表达关联结果；(ii) 从1945项染色质免疫共沉淀测序（chromatin immunoprecipitation sequencing, ChIP-seq）研究中提取的1400万个转录因子（Transcription Factor, TF）结合区域命中位点；(iii) 收录67230条已发表变异-性状关联的最新全基因组关联研究（Genome-Wide Association Study, GWAS）目录。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

ImmuneRegulation是一个综合性交互式资源，用于探索驱动细胞类型或队列特异性基因表达的免疫调控元件。它整合了大规模人类转录组数据，包括约4.3万个体的基因表达信息、约2.2亿个eQTL关联、1400万个转录因子结合位点以及最新的GWAS目录，覆盖全血和多种血细胞类型。该平台提供直观的可视化、探索和下载功能，支持用户查询和分析多种研究类型与样本数据。