MTBC_fastq

20 WGS of representatives of the <em>Mycobacterium tuberculosis</em> complex. Names on the files are the same as the run accession number. Metadata associated can thus be obtained from NCBI or EBI using the respective accession number. The lineages represented are: ERR181435 M. tuberculosis L7<br> ERR2659153 M.orygis La3<br> SRR998584 M. africanum L5<br> ERR1203059 M. africanum L5<br> ERR551620 M. africanum L5;M. tuberculosis L2 (mixed)<br> ERR2704687 M. africanum L6<br> ERR2704678 M. tuberculosis L3<br> ERR2704679 M. tuberculosis L1<br> ERR6362653 M. tuberculosis L2<br> ERR6362484 M. tuberculosis L4<br> ERR313115 M.canettii<br> ERR6362648 M. tuberculosis L2<br> ERR6362964 M. tuberculosis L2<br> ERR6362139 M. tuberculosis L4<br> ERR5987352 M. tuberculosis L4<br> ERR6362321 M. tuberculosis L2<br> ERR6361964 M. tuberculosis L2<br> ERR6362333 M. tuberculosis L2<br> ERR6052057 M. tuberculosis L2<br> SRR13046689 M. bovis La1本数据集包含20套结核分枝杆菌复合群（Mycobacterium tuberculosis complex）代表菌株的全基因组测序（Whole Genome Sequencing, WGS）数据。数据文件名与测序运行登录号完全一致，因此可通过对应登录号从NCBI或EBI获取相关元数据。本次涵盖的分型谱系如下： ERR181435：结核分枝杆菌（M. tuberculosis）L7型 ERR2659153：羊分枝杆菌（M. orygis）La3型 SRR998584：非洲分枝杆菌（M. africanum）L5型 ERR1203059：非洲分枝杆菌（M. africanum）L5型 ERR551620：非洲分枝杆菌L5型与结核分枝杆菌L2型混合样本 ERR2704687：非洲分枝杆菌（M. africanum）L6型 ERR2704678：结核分枝杆菌（M. tuberculosis）L3型 ERR2704679：结核分枝杆菌（M. tuberculosis）L1型 ERR6362653：结核分枝杆菌（M. tuberculosis）L2型 ERR6362484：结核分枝杆菌（M. tuberculosis）L4型 ERR313115：卡内蒂分枝杆菌（M. canettii） ERR6362648：结核分枝杆菌（M. tuberculosis）L2型 ERR6362964：结核分枝杆菌（M. tuberculosis）L2型 ERR6362139：结核分枝杆菌（M. tuberculosis）L4型 ERR5987352：结核分枝杆菌（M. tuberculosis）L4型 ERR6362321：结核分枝杆菌（M. tuberculosis）L2型 ERR6361964：结核分枝杆菌（M. tuberculosis）L2型 ERR6362333：结核分枝杆菌（M. tuberculosis）L2型 ERR6052057：结核分枝杆菌（M. tuberculosis）L2型 SRR13046689：牛分枝杆菌（M. bovis）La1型