ETAP Scientific Support Analysis BMDExpress2 Files

BMDExpress2 project files (.bm2 format) for each chemical and tissue analyzed using the optimal parameter configuration in Section 4.2 of "Scientific Studies Supporting Development of Transcriptomic Points of Departure for EPA Transcriptomic Assessment Products (ETAPs)" [https://doi.org/10.23645/epacomptox.25365550]. Additional information: 1) Transcriptomic data for Acrylamide exposure in Liver and Thujone exposure in Kidney both resulted in all probes failing the initial ANOVA filter (5% FDR), so there is no further analysis in these cases. 2) The analysis files for Ethinyl estradiol (EE2) have dose information in ug/kg-d. The final BMD/BMDL values were converted to mg/kg-d before performing the overall concordance analysis.本数据集涵盖按《支持美国环保署（EPA）转录组学评估产品（ETAPs）转录组学基准点开发的科学研究》[https://doi.org/10.23645/epacomptox.25365550] 第4.2节中最优参数配置完成分析的所有受试化学物质与对应组织的BMDExpress2项目文件（文件格式为.bm2）。 附加说明如下： 1） 针对肝脏中丙烯酰胺暴露与肾脏中侧柏酮暴露的转录组学数据，所有探针均未通过初始方差分析（Analysis of Variance, ANOVA）过滤（错误发现率FDR=5%），因此上述两类案例未开展后续分析。 2） 炔雌醇（Ethinyl estradiol, EE2）的分析文件中，剂量单位为微克每千克·天（μg/kg·d）。在开展整体一致性分析前，已将最终基准剂量（BMD）与基准剂量下限（BMDL）值转换为毫克每千克·天（mg/kg·d）。