Metabuli GTDB database part 1
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Metabuli GTDB Database (Version 214.1) PART 1 The Metabuli GTDB database is a pre-built database based on the Genome Taxonomy Database (GTDB) genomes and taxonomy. This database is divided into two parts due to its large size (greater than 50 GB), so please download PART 2 in the same directory. PART 2: 10.5281/zenodo.12207188 Database Specifications GTDB Version: 214.1 Genome Quality Control (QC): Assembly Level: Complete Genome or Chromosome level assemblies Completeness: CheckM completeness > 90% Contamination: CheckM. contamination < 5% Usage Put the files downloaded from PART 1 and PART 2 in the same directory. `gzip -d` for `info.gz` from PART1 and `diffIdx.gz` from PART2. The directory is now DBDIR for `classify` module.
Metabuli GTDB 数据库(版本214.1) 第一部分 Metabuli GTDB数据库是基于基因组分类数据库(Genome Taxonomy Database, GTDB)的基因组与分类学信息构建的预构建数据库。由于本数据库体积超过50 GB,体量较大,因此分为两个部分,请务必在同一目录下下载第二部分。 第二部分:10.5281/zenodo.12207188 数据库规格 GTDB版本:214.1 基因组质量控制(QC): 组装水平:完成基因组或染色体级别的组装结果 完整率:CheckM 完整率>90% 污染率:CheckM 污染率<5% 使用方式 请将从第一部分与第二部分下载的文件放置于同一目录下。 对第一部分中的`info.gz`与第二部分中的`diffIdx.gz`执行`gzip -d`解压操作。 此时该目录即可作为`classify`模块的`DBDIR`参数目录。



