All Fish Catch Data At The Safe Project 2011-2017.

Name: All Fish Catch Data At The Safe Project 2011-2017.
Creator: Zenodo
Published: 2018-11-06T10:20:15+08:00

Zenodo2020-09-20 更新2026-05-25 收录

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https://zenodo.org/record/1478526 数据链接链接失效反馈

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资源简介：

Description: All fish catch data of all methods across all streams sampled at the SAFE project, Danum Valley and surrounding oil palm areas. Please note this is the raw dataset and may contain errors that need correcting/editing. I have tried to correct the majority of errors, but all were corrected in seperate files prior to analysis, so please see specific datasets in relation to specific papers already published. All changes are detailed in the notes column or listed here if more general. All Rasbora caught in 2013 are labelled as cf. sumatrana as they were not differentiated from R. hubbsi. All Systomus changed to Barbodes. All Tor labelled as T. tambra, with no differentiation between tambra and tambroides. Project: This dataset was collected as part of the following SAFE research project: Composition and abundance of tropical freshwater vertebrate communities across a land use gradientXML metadata: GEMINI compliant metadata for this dataset is available hereFiles: This consists of 1 file: ClareW_RawDataFish.xlsxClareW_RawDataFish.xlsxThis file contains dataset metadata and 2 data tables:Fish catch data (described in worksheet Data)Description: Fish catch data Number of fields: 17Number of data rows: 16022Fields: Date: Date that stream was sampled (Field type: Date)Stream.: Which stream was sampled (Field type: Location)RA.: Which research assistant helped do the work? (Field type: Comments)Researcher: Which researcher conducted the work? Clare or Vic? (Field type: Categorical)Method: What method was used to catch the fish (Field type: Categorical)Cast_or_Trap_Numer: The cast or trap numer that the fish was caught at (Field type: Numeric)Distance: The distance along the transect in which the fish was caught (Field type: Numeric)Taxon: Species sampled (Field type: Taxa)N: The number of fish caught at that stream, location and date (Field type: Numeric)Pittagnumber: The 10 digit pit tag number (Field type: ID)Recapture: Has this fish been caught before? (Field type: Categorical)Length: Total length of fish (Field type: Numeric)Weight: Weight of fish (Field type: Numeric)Specimen: Was this fish taken as a specimen? (Field type: Categorical)Stable_isotope_Fin: Number of the stable isotope sample of all fin clips if they were taken (Field type: Numeric)Stable_isotope_Muscle: Number of the stable isotope sample of all muscle samples if they were taken (Field type: Numeric)Notes: Notes, includes any data changes, fish deaths etc. (Field type: Comments)EnvironmentalData2017 (described in worksheet EnvironmentalData2017)Description: Averaged data by stream of all measured environmental variables Number of fields: 22Number of data rows: 23Fields: Stream: Which stream was sampled (Field type: Location)Landuse: Landuse of the stream sampled (Field type: Categorical)Turbidity: Stream water turbidity (Field type: Numeric)Flow: Average flow of the stream (Field type: Numeric)Wetted_width: wetted width of the stream (Field type: Numeric)Depth: Average stream depth (Field type: Numeric)sand: Stream substrate (Field type: Numeric)gravel: Stream substrate (Field type: Numeric)pebbles: Stream substrate (Field type: Numeric)large_rocks: Stream substrate (Field type: Numeric)bedrock: Stream substrate (Field type: Numeric)Littoral.leaf.litter.cover: leaf litter on stream bed (Field type: Numeric)pH: Stream pH (Field type: Numeric)Temperature: Stream water temperature (Field type: Numeric)O2: Dissolved oxygen (Field type: Numeric)Conductivity: Stream conductivity (Field type: Numeric)Canopy.openness: Canopy openness above the stream, average from upstream, downstream, left and right bank measurements (Field type: Numeric)Sedimentation: Is there sediment within the stream? Yes or No (Field type: Categorical)CanopyOpennessRiparian: Canopy openness in the riparian, average from upstream, downstream, away from the stream and towards the stream measurements (Field type: Numeric)Vine: % vine cover (Field type: Numeric)FQ: Average SAFE project forest quality score (0-1) (Field type: Numeric)Tree: Density of trees (Field type: Numeric)Date range: 2011-09-19 to 2017-07-06Latitudinal extent: 4.5000 to 5.0700Longitudinal extent: 116.7500 to 117.8200Taxonomic coverage: All taxon names are validated against the GBIF backbone taxonomy. If a dataset uses a synonym, the accepted usage is shown followed by the dataset usage in brackets. Taxa that cannot be validated, including new species and other unknown taxa, morphospecies, functional groups and taxonomic levels not used in the GBIF backbone are shown in square brackets.Animalia - Chordata - - Actinopterygii - - - Anguilliformes - - - - Anguillidae - - - - - Anguilla - - - - - - Anguilla borneensis - - - - - - Anguilla marmorata - - - Cypriniformes - - - - Balitoridae - - - - - Gastromyzon - - - - - - Gastromyzon ingeri - - - - - - Gastromyzon lepidogaster - - - - - - Gastromyzon umbrus - - - - - Homalopteroides - - - - - - Homalopteroides stephensoni - - - - - Parhomaloptera - - - - - - Parhomaloptera microstoma - - - - - Protomyzon - - - - - - Protomyzon borneensis - - - - - - Protomyzon griswoldi - - - - - - Protomyzon whiteheadi - - - - Cyprinidae - - - - - Anematichthys - - - - - - Anematichthys repasson - - - - - Barbonymus - - - - - - [Barbodes collingwoodi] - - - - - - Barbonymus balleroides - - - - - Crossocheilus - - - - - - [Crosseocheilus elegans] - - - - - Cyclocheilichthys - - - - - Garra - - - - - - Garra borneensis - - - - - Hampala - - - - - - Hampala sabana - - - - - Leptobarbus - - - - - - Leptobarbus melanotaenia - - - - - Lobocheilos - - - - - - Lobocheilos erinaceus - - - - - - Lobocheilos unicornis - - - - - Luciosoma - - - - - - [Luciosoma pelligrinii] - - - - - Nematabramis - - - - - - Nematabramis borneensis - - - - - - Nematabramis everetti - - - - - Osteochilus - - - - - - Osteochilus chini - - - - - - Osteochilus ingeri - - - - - Puntius - - - - - - Puntius sealei - - - - - Rasbora - - - - - - Rasbora elegans - - - - - - Rasbora hubbsi - - - - - - [Rasbora pycnopeza] - - - - - Tor - - - - - - Tor tambra - - - - Nemacheilidae - - - - - Nemacheilus - - - - - - Nemacheilus olivaceus - - - Perciformes - - - - Channidae - - - - - Channa - - - - - - Channa striata - - - - Cichlidae - - - - - Oreochromis - - - - - - Oreochromis mossambicus - - - - Osphronemidae - - - - - Betta - - - - - - Betta unimaculata - - - Siluriformes - - - - Bagridae - - - - - Hemibagrus - - - - - - Hemibagrus baramensis - - - - - - Hemibagrus fortis - - - - Clariidae - - - - - Clarias - - - - - - Clarias anfractus - - - - - - [Clarias teysmanni] - - - Synbranchiformes - - - - Mastacembelidae - - - - - Macrognathus - - - - - - Macrognathus keithi - - - - - Mastacembelus - - - - - - Mastacembelus unicolor

描述：本数据集收录了达努谷（Danum Valley）及周边油棕种植区SAFE项目（SAFE Project）中所有采样溪流的各类渔获方法的全部渔获数据。请注意，本数据集为原始数据集，可能包含需修正的错误。本人已修正了绝大多数错误，但所有校正工作均已在分析前于独立文件中完成，因此请参阅与已发表特定论文相关的专用数据集。所有数据变更均已在备注列中详细说明，若为通用变更则在此处列出。2013年捕获的所有波鱼属（Rasbora）个体均被标记为cf. 苏门答腊波鱼，因当时未将其与哈布斯波鱼（R. hubbsi）区分开。所有原归类为Systomus属的物种均更改为Barbodes属。所有鲈鲤属（Tor）个体均被标记为T. tambra，未区分Tambra与Tambroides类群。项目：本数据集作为以下SAFE研究项目的一部分采集完成：**热带淡水脊椎动物群落在土地利用梯度下的组成与丰度**（原标题：Composition and abundance of tropical freshwater vertebrate communities across a land use gradient） XML元数据：本数据集符合GEMINI（Geospatial Metadata Initiative）标准的元数据可在此处获取。文件：本数据集包含1个文件：ClareW_RawDataFish.xlsx。 **ClareW_RawDataFish.xlsx** 该文件包含数据集元数据与2个数据表： ### 渔获数据（Fish catch data）（位于Data工作表中）描述：渔获数据字段数：17 数据行数：16022 字段说明： - 采样日期（Date）：溪流采样日期（字段类型：日期） - 溪流编号（Stream.）：采样溪流编号（字段类型：位置） - 研究助理（RA.）：协助开展采样工作的研究助理（字段类型：备注） - 研究人员（Researcher）：负责开展采样工作的研究人员（Clare或Vic）（字段类型：分类变量） - 采样方法（Method）：鱼类采集所用的方法（字段类型：分类变量） - 投网/陷阱编号（Cast_or_Trap_Numer）：鱼类被捕获时所在的投网或陷阱编号（字段类型：数值型） - 样带距离（Distance）：鱼类被捕获所在样带的沿程距离（字段类型：数值型） - 分类单元（Taxon）：采样物种（字段类型：分类单元） - 个体数量（N）：该采样溪流、点位与日期下捕获的鱼类数量（字段类型：数值型） - PIT标签编号（Pittagnumber）：10位植入式被动集成应答器标签编号（字段类型：标识号） - 重捕标记（Recapture）：该鱼是否曾被捕获过？（字段类型：分类变量） - 总长度（Length）：鱼类的总长度（字段类型：数值型） - 体重（Weight）：鱼类的体重（字段类型：数值型） - 标本采集（Specimen）：该鱼是否被作为标本留存？（字段类型：分类变量） - 鳍组织稳定同位素样本编号（Stable_isotope_Fin）：若采集鳍组织用于稳定同位素分析，则为对应样本编号（字段类型：数值型） - 肌肉组织稳定同位素样本编号（Stable_isotope_Muscle）：若采集肌肉组织用于稳定同位素分析，则为对应样本编号（字段类型：数值型） - 备注（Notes）：备注信息，包括所有数据变更、鱼类死亡情况等（字段类型：备注） ### 2017年环境数据（EnvironmentalData2017）（位于EnvironmentalData2017工作表中）描述：按溪流汇总的所有实测环境变量平均值字段数：22 数据行数：23 字段说明： - 溪流（Stream）：采样溪流（字段类型：位置） - 土地利用类型（Landuse）：采样溪流所在区域的土地利用类型（字段类型：分类变量） - 浊度（Turbidity）：溪流水体浊度（字段类型：数值型） - 流量（Flow）：溪流平均流量（字段类型：数值型） - 过水宽度（Wetted_width）：溪流过水宽度（字段类型：数值型） - 平均水深（Depth）：溪流平均水深（字段类型：数值型） - 沙质底物占比（sand）：溪流底质沙粒占比（字段类型：数值型） - 砾石底物占比（gravel）：溪流底质砾石占比（字段类型：数值型） - 卵石底物占比（pebbles）：溪流底质卵石占比（字段类型：数值型） - 大块岩石底物占比（large_rocks）：溪流底质大块岩石占比（字段类型：数值型） - 基岩底物占比（bedrock）：溪流底质基岩占比（字段类型：数值型） - 叶面凋落物覆盖度（Littoral.leaf.litter.cover）：溪流床的叶面凋落物覆盖度（字段类型：数值型） - pH值（pH）：溪流水体pH值（字段类型：数值型） - 水温（Temperature）：溪流水体温度（字段类型：数值型） - 溶解氧（O2）：水体溶解氧含量（字段类型：数值型） - 电导率（Conductivity）：溪流水体电导率（字段类型：数值型） - 冠层开度（Canopy.openness）：溪流上方冠层开度，为上游、下游、左岸与右岸测量值的平均值（字段类型：数值型） - 沉积物淤积情况（Sedimentation）：溪流内是否存在沉积物淤积？是或否（字段类型：分类变量） - 河岸带冠层开度（CanopyOpennessRiparian）：河岸带冠层开度，为上游、下游、远离溪流与朝向溪流方向测量值的平均值（字段类型：数值型） - 藤蔓覆盖度（Vine）：藤蔓覆盖百分比（字段类型：数值型） - 森林质量评分（FQ）：SAFE项目的平均森林质量评分（0~1）（字段类型：数值型） - 树木密度（Tree）：树木密度（字段类型：数值型）日期范围：2011-09-19 至 2017-07-06 纬度范围：4.5000 至 5.0700 经度范围：116.7500 至 117.8200 分类学覆盖范围：所有分类单元名称均已通过GBIF骨干分类法（GBIF Backbone Taxonomy）进行验证。若数据集使用了异名，则会先展示接受的学名，随后以括号标注数据集所用名称。无法验证的类群（包括新种与其他未知类群、形态种、功能群以及GBIF骨干分类法中未收录的分类等级）将以方括号标注。动物界（Animalia） - 脊索动物门（Chordata） - 辐鳍鱼纲（Actinopterygii） - 鳗鲡目（Anguilliformes） - 鳗鲡科（Anguillidae） - 鳗鲡属（Anguilla） - Anguilla borneensis - Anguilla marmorata - 鲤形目（Cypriniformes） - 爬鳅科（Balitoridae） - 腹吸鳅属（Gastromyzon） - Gastromyzon ingeri - Gastromyzon lepidogaster - Gastromyzon umbrus - 平鳍鳅属（Homalopteroides） - Homalopteroides stephensoni - 副平鳍鳅属（Parhomaloptera） - Parhomaloptera microstoma - 原吸鳅属（Protomyzon） - Protomyzon borneensis - Protomyzon griswoldi - Protomyzon whiteheadi - 鲤科（Cyprinidae） - 安氏鱼属（Anematichthys） - Anematichthys repasson - 四须鲃属（Barbonymus） - [Barbodes collingwoodi] - Barbonymus balleroides - 穗唇鲃属（Crossocheilus） - [Crosseocheilus elegans] - 圆唇鱼属（Cyclocheilichthys） - 野鲮属（Garra） - Garra borneensis - 大鳞鲃属（Hampala） - Hampala sabana - 细鳞鲃属（Leptobarbus） - Leptobarbus melanotaenia - 唇鲃属（Lobocheilos） - Lobocheilos erinaceus - Lobocheilos unicornis - 细鲫属（Luciosoma） - [Luciosoma pelligrinii] - 线鲃属（Nematabramis） - Nematabramis borneensis - Nematabramis everetti - 骨唇鱼属（Osteochilus） - Osteochilus chini - Osteochilus ingeri - 无须魮属（Puntius） - Puntius sealei - 波鱼属（Rasbora） - Rasbora elegans - Rasbora hubbsi - [Rasbora pycnopeza] - 鲈鲤属（Tor） - Tor tambra - 条鳅科（Nemacheilidae） - 条鳅属（Nemacheilus） - Nemacheilus olivaceus - 鲈形目（Perciformes） - 鳢科（Channidae） - 鳢属（Channa） - Channa striata - 慈鲷科（Cichlidae） - 罗非鱼属（Oreochromis） - Oreochromis mossambicus - 丝足鲈科（Osphronemidae） - 斗鱼属（Betta） - Betta unimaculata - 鲇形目（Siluriformes） - 鲿科（Bagridae） - 半鲿属（Hemibagrus） - Hemibagrus baramensis - Hemibagrus fortis - 胡子鲇科（Clariidae） - 胡子鲇属（Clarias） - Clarias anfractus - [Clarias teysmanni] - 合鳃鱼目（Synbranchiformes） - 刺鳅科（Mastacembelidae） - 大刺鳅属（Macrognathus） - Macrognathus keithi - 刺鳅属（Mastacembelus） - Mastacembelus unicolor

提供机构：

Zenodo

创建时间：

2018-11-06

All Fish Catch Data At The Safe Project 2011-2017.

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