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Green Revolution rice genomes annotation files

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Figshare2022-03-12 更新2026-04-08 收录
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资源简介:

Annotation of the Green Revolution-related cultivars Taichung Native 1 (TN1), IR8, MH63 and IR64.<br>Version 3 contains the complete set of files including the TN1 assembly. The unplaced scaffolds/contigs are not included in the TN1 fasta file available for download in NCBI. That's why I uploaded the complete set of chromosomes and unplaced scaffolds/contigs here.<br>Md5sum of the TN1 fasta file is ad12762b438db5d53ab912e262623aef .<br>If you want to use this data please cite as:Panibe, Jerome P et al. “Chromosomal-level genome assembly of the semi-dwarf rice Taichung Native 1, an initiator of Green Revolution.” <i>Genomics</i> vol. 113,4 (2021): 2656-2674. doi:10.1016/j.ygeno.2021.06.006<br>

本数据集为与绿色革命相关的水稻栽培品种台中本地1号(Taichung Native 1,简称TN1)、IR8、明恢63(MH63)以及IR64的基因组注释信息。 版本3包含完整文件集,其中涵盖TN1的基因组组装结果。NCBI可下载的TN1 FASTA格式文件未包含未锚定的支架序列(scaffolds)与重叠群(contigs),因此本数据集上传了包含全部染色体序列以及未锚定的支架与重叠群在内的完整文件集。 TN1的FASTA格式文件的MD5校验和为ad12762b438db5d53ab912e262623aef。 若需使用本数据集,请引用如下文献:Panibe, Jerome P 等。《半矮秆水稻台中本地1号——绿色革命发起品种的染色体级基因组组装》,刊载于《Genomics》(《基因组学》),第113卷第4期(2021年),页码2656-2674,DOI: 10.1016/j.ygeno.2021.06.006。

提供机构:
Panibe, Jerome
创建时间:
2022-03-11
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