Data presented in Brinkmann et al., 2021, Aquat. Toxicol.

These files include all data presented in:

Brinkmann et al., 2021. Adsorption of titanium dioxide nanoparticles onto zebrafish eggs affects colonizing microbiota. Aquatic Toxicology.

16SrRNA_(...)
fasta and fastq formatted 16SrRNA sequences (Fig. 3c/ Table S4) with in the description line:
* Colony numbers corresponding to the numbers included in Table S4
* The applied sequencing primer (27F)
* NP exposure: nTiO2 (5 mg/L) or Control (no NPs)
* A code referring to the parental zebrafish family that was crossed to obtain the larvae (A7, A8, or A9)

2photon_(...)
* Two-photon scans of Fig. 2
* ROI sets of Fig. 2b/e (zipped)
* Wavelength and focus information (.dat files)

CLSM_(...)
* CLSM scans of Fig. 3b (zipped)
* ROI (zipped)
* Metadata, where scanID corresponds to scan and ROI numbers of the zipped data

CFUcounts_(...)
CFU count data (Fig. 4/ Fig. S7):
* Compound: Exposure: nTiO2 (5 mg/L), nAg (0.25 mg Ag/L), or control (no NPs)
* LifeStage: Analyzed life stage: Embryo (1 dpf) or Larvae (5 dpf)
* Date: Date of CFU isolation
* DilutionFactor: Counted dilution
* CFU_Larvae: CFU count per egg or larva

DLS_(...)
DLS measurements for nTiO2 (Table 2):
* Time: Incubation time (h)
* Concentration: Nominal concentration (mg/L)
* ZP: Zeta potential (mV)
* d_size: Z-averag size (nm)

DoseResponses_(...)
Mortality data of zebrafish larvae exposed to nTiO2 from 3-5 dpf (Fig. S6):
* Concentration: Nominal exposure concentration (mg/L)
* Day: Exposure time (days).
* Mortality: Percentage of larvae that had died
* Date: The date at which the mortality was scored

EcoPlate_(...)
EcoPlate measurement data (Fig. 5/ S3/ S8/ S9):
* Compound: Zebrafish egg exposure: nTiO2 (5 mg/L), nAg (0.25 mg Ag/L), or Control (no NPs)
* LifeStage: Analyzed life stage: Embryo (1 dpf) or Larvae (5 dpf)
* Time: Incubation time (h)
* Date: Date of the measurement
* EcoPlate: Number of the EcoPlate
* Measurement: Measurement number (3 measurements per plate)
* 32 substrates (final 32 columns): OD at 590 nm measured for the given substrate

PIXE_(...)
PIXE measurements (Fig. 1/ Table S2):
* ExposureConcentration: Nominal concentration of nTiO2 (mg/L)
* Replicate: Replicate number
* EggCount: Number of eggs that was analyzed
* Date: Date at which the sample was taken
* mL_EggWater: Volume of egg water (mL) that was analyzed along with the eggs
* Element: Measured element
* Total_ppm: Elemental concentration (ppm)
* LOD_ppm: LOD (ppm)
* ng_Element_per_egg: Elemental concentration (ng/egg)
* LOD_ng_per_egg: LOD (ng/egg)

TiO2Sedimentation_(...)
ICP-OES measurements of Ti for sedimentation analyses (Fig. S4):
* Time: Incubation time (h)
* ExposureTiO2: Nominal concentration of nTiO2 (mg/L)
* MediaTi: Measured concentration of Ti (mg/L)
* MediaTiO2: Measured concentration of TiO2 (mg/L)

UVspectra_(...)
UV-light spectra (Fig. S1):
* wavelength: Measured wavelength (nm)
* irradiance: Measured irradiance (uW/cm2/nm)
* spectrum: Number of the acquired spectrum

本数据集包含Brinkmann等人2021年发表论文中的全部呈现数据：Brinkmann et al., 2021. Adsorption of titanium dioxide nanoparticles onto zebrafish eggs affects colonizing microbiota. Aquatic Toxicology. 即《二氧化钛纳米颗粒吸附于斑马鱼卵会影响定殖微生物群》，刊载于《水生毒理学》（Aquatic Toxicology）。

### 16S核糖体RNA（16S rRNA）相关数据集
采用fasta与fastq格式存储的16S核糖体RNA序列（对应图3c/附表S4），序列描述行包含以下信息：
* 与附表S4中编号对应的菌落编号
* 所用测序引物（27F）
* 纳米颗粒暴露处理：nTiO₂（5 mg/L）或对照组（无纳米颗粒）
* 用于获得幼鱼的亲代斑马鱼交配家系代码（A7、A8或A9）

### 双光子成像相关数据集
* 对应图2的双光子扫描图像
* 图2b/e的感兴趣区域（ROI）集（已压缩打包）
* 波长与焦距信息文件（.dat格式）

### 共聚焦激光扫描显微镜（CLSM）相关数据集
* 对应图3b的CLSM扫描图像（已压缩打包）
* 感兴趣区域（ROI，已压缩打包）
* 元数据，其中scanID对应压缩数据的扫描编号与ROI编号

### 菌落形成单位（CFU）计数相关数据集
CFU计数数据（对应图4/图S7）：
* 暴露化合物：nTiO₂（5 mg/L）、nAg（0.25 mg Ag/L）或对照组（无纳米颗粒）
* 生命阶段：分析样本的发育阶段：胚胎（受精后1天，1 dpf）或幼鱼（受精后5天，5 dpf）
* 日期：CFU分离日期
* 稀释因子：计数时采用的稀释倍数
* CFU_Larvae：单颗卵或单尾幼鱼的CFU计数

### 动态光散射（DLS）相关数据集
针对nTiO₂的DLS测量数据（对应表2）：
* 时间：孵育时长（h）
* 浓度：标称暴露浓度（mg/L）
* ZP：Zeta电位（mV）
* d_size：Z平均粒径（nm）

### 剂量反应相关数据集
斑马鱼幼鱼于3至5 dpf暴露于nTiO₂的死亡率数据（对应图S6）：
* 浓度：标称暴露浓度（mg/L）
* 天数：暴露时长（天）
* 死亡率：死亡幼鱼所占百分比
* 日期：死亡率统计日期

### EcoPlate 测量相关数据集
EcoPlate测量数据（对应图5/图S3/图S8/图S9）：
* 暴露化合物：斑马鱼卵暴露处理：nTiO₂（5 mg/L）、nAg（0.25 mg Ag/L）或对照组（无纳米颗粒）
* 生命阶段：分析样本的发育阶段：胚胎（1 dpf）或幼鱼（5 dpf）
* 时间：孵育时长（h）
* 日期：测量日期
* EcoPlate：EcoPlate编号
* 测量次数：每块板的重复测量次数（共3次）
* 32种底物（对应最终32列）：对应底物在590 nm处的光密度（OD）值

### 质子诱导X射线发射（PIXE）相关数据集
PIXE测量数据（对应图1/附表S2）：
* 暴露浓度：nTiO₂的标称浓度（mg/L）
* 重复次数：重复实验编号
* 卵数量：分析的卵的总数
* 日期：样本采集日期
* mL_EggWater：与卵一同分析的卵水体积（mL）
* 元素：被测元素种类
* 总_ppm：元素浓度（ppm）
* LOD_ppm：检出限（ppm）
* ng_Element_per_egg：单颗卵的元素含量（ng/egg）
* LOD_ng_per_egg：单颗卵的检出限（ng/egg）

### 二氧化钛沉降相关数据集
用于沉降分析的钛（Ti）电感耦合等离子体发射光谱（ICP-OES）测量数据（对应图S4）：
* 时间：孵育时长（h）
* ExposureTiO2：nTiO₂的标称浓度（mg/L）
* MediaTi：测得的钛（Ti）浓度（mg/L）
* MediaTiO2：测得的二氧化钛（TiO₂）浓度（mg/L）

### 紫外光谱相关数据集
紫外光谱数据（对应图S1）：
* 波长：测量波长（nm）
* 辐照度：测得的辐照度（μW/cm²/nm）
* 光谱编号：获取的光谱序号