geNomad database
收藏资源简介：
Marker database used by geNomad for virus and plasmid identification. <strong>genomad_db_v1.5.tar.gz:</strong> MMseqs2 profile database. Entries are decorated with taxonomy information from a custom taxdump based on ICTV's VMR number 19. <strong>genomad_hmm_v1.5.tar.gz:</strong> HMMER HMM models. <strong>genomad_metadata_v1.5.tsv.gz:</strong> Metadata for all the 227,897 markers. <strong>genomad_msa_v1.5.tar.gz:</strong> Multiple sequence alignments in FASTA format.
本数据库为geNomad用于病毒与质粒识别的标记物数据库。 <strong>genomad_db_v1.5.tar.gz:</strong> MMseqs2 谱图数据库，其中所有条目均附带基于国际病毒分类委员会（International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV）第19版病毒元数据报告（Virus Metadata Report, VMR）构建的自定义分类树所提供的分类学注释信息。 <strong>genomad_hmm_v1.5.tar.gz:</strong> HMMER 隐马尔可夫模型库。 <strong>genomad_metadata_v1.5.tsv.gz:</strong> 涵盖全部227,897个标记物的元数据文件。 <strong>genomad_msa_v1.5.tar.gz:</strong> 采用FASTA格式存储的多序列比对数据集。
