TABLE 1 in Murichromolaenicola thailandensis sp. nov. (Phaeosphaeriaceae, Dothideomycetes) from Chromolaena odorata (Asteraceae) in northern Thailand

TABLE 1. Gene regions, primers and PCR amplification conditions used in this study. GenePrimers ForwardReversePCR ConditionsReferencesLarge subunit (LSU)LR0RLR595 °C: 3 min, (94 °C: 30 s, 56 °C: 50 s, 72 °C: 1 min) × 40 cycles 72 °C: 7 min.Vilgalys & Hester (1990)Small subunit (SSU)NS1NS495 °C for 3 min, (94 °C: 30 s, 55 °C: 50 s, 72 °C:1 min) × 40 cycles 72 °C: 7 min.White et al. (1990)Internal transcribed spacer (ITS)ITS5ITS495 °C for 3 min, (94 °C: 30 s, 55 °C: 50 s, 72 °C:1 min) × 40 cycles 72 °C: 7 min.White et al. (1990)Elongation factor-1 alpha (tef1- α)EF-1 983FEF1-2218R95 °C: 3 min, (94 °C: 30 s, 55 °C: 50 s, 72 °C: 1 min) × 40 cycles 72 °C: 7 min.Rehner (2001)RNA polymerase II subunit (rpb2)fRPB2-5 FfRPB2-7cR95 °C: 5 min, (95 °C:1 min, 52 °C: 2 min, 72 °C: 90 s) × 40 cycles 72 °C: 10 minLiu et al. (1999)表1 本研究中使用的基因区域、引物及聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction，PCR）扩增条件 | 基因区域 | 引物（正向/反向） | PCR扩增条件 | 参考文献 | | --- | --- | --- | --- | | 大亚基（Large subunit, LSU） | LR0R / LR5 | 95 ℃预变性3 min，（94 ℃变性30 s、56 ℃退火50 s、72 ℃延伸1 min）循环40次，72 ℃终延伸7 min | Vilgalys & Hester (1990) | | 小亚基（Small subunit, SSU） | NS1 / NS4 | 95 ℃预变性3 min，（94 ℃变性30 s、55 ℃退火50 s、72 ℃延伸1 min）循环40次，72 ℃终延伸7 min | White et al. (1990) | | 内转录间隔区（Internal transcribed spacer, ITS） | ITS5 / ITS4 | 95 ℃预变性3 min，（94 ℃变性30 s、55 ℃退火50 s、72 ℃延伸1 min）循环40次，72 ℃终延伸7 min | White et al. (1990) | | 延伸因子-1α（Elongation factor-1 alpha, tef1-α） | EF-1 983F / EF1-2218R | 95 ℃预变性3 min，（94 ℃变性30 s、55 ℃退火50 s、72 ℃延伸1 min）循环40次，72 ℃终延伸7 min | Rehner (2001) | | RNA聚合酶Ⅱ亚基（RNA polymerase II subunit, rpb2） | fRPB2-5F / fRPB2-7cR | 95 ℃预变性5 min，（95 ℃变性1 min、52 ℃退火2 min、72 ℃延伸90 s）循环40次，72 ℃终延伸10 min | Liu et al. (1999) |