Data for A conservation genomics workflow to guide practical management actions.
收藏Mendeley Data2021-02-11 更新2026-04-09 收录
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11/02/2021 This archive contains code and data associated with a manuscript: A conservation genomics workflow to guide practical management actions. Note: the code is intended to serve as an archive in association with a published article. You are welcome to contact samantha.yap@rbgsyd.nsw.gov.au about the script or data. It contains the following directories: - code 1OPTGENMIX_data cleaning.R & 2OPTGENMIX.R Implementation of algorithms for performing optimizations Banksia code.R Code used to perform analyses of Banksia Daphnandra code.R Code used to perform analyses of Daphnandra - data / Banksia Report_DBank18-3485_SNP_singlerow.csv genotype data supplied by DArT (Note: data in DArT format, with 0=hom ref; 1=hom alt; 2=het) Vinc_DBank18-3485_meta.xlsx metadata information. / Daphnandra Report-DDap9-4181.xlsx genotype data supplied by DArT Note: samples from different taxa, and not analyzed in this study, removed for this archive. (Note: data in DArT format, with 0=hom ref; 1=hom alt; 2=het) Daphnandra_DDap9-4181_meta.xlsx metadata information.
2021年11月2日 本存档包含与一篇学术手稿相关的代码与数据：《用于指导实际管理行动的保护基因组学工作流》（A conservation genomics workflow to guide practical management actions）。注意：本代码仅作为已发表论文的配套存档文件。您可通过邮箱samantha.yap@rbgsyd.nsw.gov.au咨询该脚本或数据相关问题。本存档包含以下目录：
- 代码目录：
1. 1OPTGENMIX_data cleaning.R 与 2OPTGENMIX.R：用于执行优化算法的实现代码
2. Banksia code.R：用于开展Banksia属植物分析的代码
3. Daphnandra code.R：用于开展Daphnandra属植物分析的代码
- 数据目录：
/Banksia 子目录：
1. Report_DBank18-3485_SNP_singlerow.csv：由DArT提供的单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism，SNP）单行基因型数据（注：数据采用DArT格式，其中0表示纯合参考型，1表示纯合变异型，2表示杂合型）
2. Vinc_DBank18-3485_meta.xlsx：元数据信息
/Daphnandra 子目录：
1. Report-DDap9-4181.xlsx：由DArT提供的基因型数据（注：本研究未分析的不同类群样本已从本存档中移除；数据采用DArT格式，其中0表示纯合参考型，1表示纯合变异型，2表示杂合型）
2. Daphnandra_DDap9-4181_meta.xlsx：元数据信息
创建时间：
2021-02-11
