Simulation Popc_512_Tm3_10_5Up_5Down_Nacl_150Mm_310K (Rep3)

<strong>Title publication: </strong><em>A Ceramide-Regulated Element in the Late Endosomal Protein LAPTM4B Controls Amino Acid Transporter Interaction</em> <strong><strong>Year publication:</strong></strong><strong> </strong>2018 <strong>DOI publication: </strong>10.1021/acscentsci.7b00582 <strong>Description:</strong> Simulation POPC membrane containing ten LAPTM4B-TM3 peptides using charmm36 at 310K. <strong>MD engine:</strong> 5.1.3-dev-20160627-f16daab<br> <br> <strong>Force field</strong>: charmm36 <strong>Temperature</strong>: 310 K <strong>Pressure:</strong> 1 bar <strong>Simulation time</strong>: 2068 ns <strong>Saving frequency</strong>: 100 ps <strong>Molecular content</strong>: TM3 10<br> POPC 512<br> SOL 29366<br> NA 89<br> CL 79 <strong>Additional </strong><strong>information</strong>:<br> * Membrane containing LAPTM4B TM3 peptides.<strong>出版物标题：</strong><em>晚期内体蛋白（Late Endosomal Protein）LAPTM4B中受神经酰胺（Ceramide）调控的元件调控氨基酸转运体（Amino Acid Transporter）相互作用</em> <strong>出版年份：</strong>2018 <strong>出版物DOI：</strong>10.1021/acscentsci.7b00582 <strong>数据集描述：</strong>使用CHARMM36力场，在310K下对包含10个LAPTM4B-TM3肽的1-棕榈酰基-2-油酰基-sn-甘油-3-磷酸胆碱（POPC）膜进行分子动力学模拟。 <strong>分子动力学引擎：</strong>5.1.3-dev-20160627-f16daab<br> <br> <strong>力场：</strong>CHARMM36 <strong>温度：</strong>310 K <strong>压力：</strong>1 巴 <strong>模拟时长：</strong>2068 ns <strong>数据保存频率：</strong>100 ps <strong>体系分子组成：</strong><br> TM3肽：10<br> 1-棕榈酰基-2-油酰基-sn-甘油-3-磷酸胆碱（POPC）：512<br> 溶剂水（SOL）：29366<br> 钠离子（Na⁺）：89<br> 氯离子（Cl⁻）：79 <strong>附加信息：</strong><br> * 包含LAPTM4B TM3肽的膜