Genome and annotation data for the salp Pegea sp.

Genome assembly, structural annotation, functional annotation, quantification, and long-read transcriptome data for the salp Pegea sp. Files: RAD2-039_final_filtered_genome.fasta --> Genome assembly file RAD2-039_genome_mRNAs.fasta --> mRNAs derived from the genome using FINDER RAD2-039_genome_proteins.fasta --> proteins derived from the genomeRAD2-039_FINDER_BRAKER_PROT.gtf --> annotation file RAD2-039_iproscan.tsv --> functional annotation (interproscan) of the proteins RAD2-039_expressionMatrix_cpms.csv --> gene expression data in counts per million from two replicate samples of the same animalRAD2-039_ISOseq_clustered.hq.fasta --> long read mRNA data (PacBio IsoSeq)本数据集涵盖海樽类佩杰海樽（Pegea sp.）的基因组组装（Genome assembly）、结构注释（Structural annotation）、功能注释（Functional annotation）、基因定量（Quantification）数据及长读长转录组数据（long-read transcriptome data）。 数据集包含以下文件： 1. RAD2-039_final_filtered_genome.fasta：基因组组装文件 2. RAD2-039_genome_mRNAs.fasta：通过FINDER工具从基因组序列中预测得到的mRNA序列文件 3. RAD2-039_genome_proteins.fasta：从基因组序列中预测得到的蛋白质序列文件；RAD2-039_FINDER_BRAKER_PROT.gtf：结构注释文件（GTF格式） 4. RAD2-039_iproscan.tsv：基于InterProScan分析的蛋白质功能注释文件（TSV格式） 5. RAD2-039_expressionMatrix_cpms.csv：来自同一只实验动物的两个重复样本的百万计数（CPM）格式基因表达矩阵文件 6. RAD2-039_ISOseq_clustered.hq.fasta：PacBio IsoSeq平台产出的长读长mRNA高质量聚类序列文件