Figure1 - WholeGenomeSequencingAtlanticPuffin(71)
收藏DataCite Commons2021-07-26 更新2024-07-28 收录
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Files needed to recreate Figure 1 in the publication - Kersten et al. 2021 - DOI: <b>10.1038/s42003-021-02415-4</b><br>(https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.05.351874v2.full)<br>1. Covariance matrix of 71 Atlantic puffin nuclear genomes (output from PCAngsd).<br>2. Q-matrices of 71 Atlantic puffin nuclear genomes (output from CLUMPAK after ngsAdmix).<br>3. Nexus file as input for Fitchi for the haplotype network. (71 Atlantic puffin mitochondrial genomes)<br>4. Coordinates of sample locations (for map).<br>Detailed methods can be found in the manuscript.<br>
本数据集涵盖复现Kersten等人2021年发表论文中图1所需的全部文件——论文DOI：10.1038/s42003-021-02415-4，预印本链接：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.05.351874v2.full。
1. 71个大西洋海雀（Atlantic puffin）核基因组的协方差矩阵（PCAngsd软件的输出结果）
2. 71个大西洋海雀核基因组的Q矩阵（经ngsAdmix分析后，由CLUMPAK软件导出的结果）
3. 用于Fitchi软件构建单倍型网络的Nexus格式输入文件（对应71个大西洋海雀线粒体基因组）
4. 样本采集位置坐标（用于绘制地图）
详细的实验方法可参阅该研究论文。
提供机构：
figshare
创建时间：
2021-06-07
