Metagenome assemblies in the MetaPlatanus study

Metagenome assemblies generate in the study of MetaPlatanus, a de novo metagenome assemblers. These are the results from multiple de novo assemblers. The samples are the mock with long reads (GIS20 mock), the mock with mate-pair (MP mock), human guts, and human saliva.<br>References for samples (GIS20 mock, human guts, human saliva, and MP mock):Bertrand,D., Shaw,J., Kalathiyappan,M., Ng,A.H.Q., Kumar,M.S., Li,C., Dvornicic,M., Soldo,J.P., Koh,J.Y., Tong,C., <i>et al.</i> (2019) Hybrid metagenomic assembly enables high-resolution analysis of resistance determinants and mobile elements in human microbiomes. <i>Nat. Biotechnol.</i>, <b>37</b>, 937–944.<br>Yahara,K., Suzuki,M., Hirabayashi,A., Suda,W., Hattori,M., Suzuki,Y. and Okazaki,Y. (2021) Long-read metagenomics using PromethION uncovers oral bacteriophages and their interaction with host bacteria. <i>Nat Commun</i>, <b>12</b>, 27.<br><br>BioProject PRJDB4377 in the Sequence Read Archive.<br>

本数据集包含的宏基因组组装结果源自针对MetaPlatanus（一款从头（de novo）宏基因组组装软件）的相关研究，同时涵盖多款其他从头宏基因组组装工具的组装结果。
本次研究使用的样本包括带有长读长（long reads）的模拟群落（GIS20 mock）、带有配对末端读段（mate-pair）的模拟群落（MP mock）、人类肠道样本以及人类唾液样本。
本研究所用样本（GIS20 mock、人类肠道样本、人类唾液样本及MP mock）的相关参考文献如下：
Bertrand,D.、Shaw,J.、Kalathiyappan,M.、Ng,A.H.Q.、Kumar,M.S.、Li,C.、Dvornicic,M.、Soldo,J.P.、Koh,J.Y.、Tong,C. 等（2019）：杂交宏基因组组装可实现人类微生物组中抗性决定簇与可移动遗传元件的高分辨率分析。《自然·生物技术》（*Nat. Biotechnol.*），第37卷，937–944页。
Yahara,K.、Suzuki,M.、Hirabayashi,A.、Suda,W.、Hattori,M.、Suzuki,Y.及Okazaki,Y.（2021）：利用PromethION平台开展的长读长宏基因组学研究揭示了口腔噬菌体及其与宿主细菌的互作关系。《自然·通讯》（*Nat Commun*），第12卷，27页。

该数据集对应的生物项目（BioProject）编号为PRJDB4377，已上传至序列读取档案（Sequence Read Archive）。