Simulation Cer160_50_Popc_512_Tm3_D202A_10_5Up_5Down_Nacl_150Mm_310K (Rep1)
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<strong>Title publication: </strong><em>A Ceramide-Regulated Element in the Late Endosomal Protein LAPTM4B Controls Amino Acid Transporter Interaction</em> <strong><strong>Year publication:</strong></strong><strong> </strong>2018 <strong>DOI publication: </strong>XXXXX <strong>Description:</strong> Simulation POPC membrane containing ~8 mol% ceramide (CER160) and ten LAPTM4B-TM3 peptides with a D202A mutation using charmm36 at 310K. <strong>MD engine:</strong> 2016.2-dev-20170105-4feb0be <strong>Force field</strong>: charmm36 <strong>Temperature</strong>: 310 K <strong>Pressure:</strong> 1 bar <strong>Simulation time</strong>: 2940 ns <strong>Saving frequency</strong>: 100 ps <strong>Molecular content</strong>:<br> TM3_D2A 10<br> POPC 512<br> CER160 50<br> SOL 28090<br> NA 75<br> CL 75 <strong>Additional </strong><strong>information</strong>:<br> * Membrane containing LAPTM4B TM3 peptides with a D202A mutation.
<strong>出版物标题：</strong><em>晚期内体蛋白LAPTM4B内的神经酰胺（ceramide）调控元件调控氨基酸转运体相互作用</em> <strong>出版年份：</strong>2018 <strong>出版物DOI：</strong>XXXXX <strong>数据集描述：</strong>本模拟体系采用charmm36力场，于310K下构建，为包含约8mol%神经酰胺（ceramide, CER160）与10条携带D202A突变的LAPTM4B-TM3肽段的1-棕榈酰-2-油酰-sn-甘油-3-磷酸胆碱（1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine, POPC）膜体系。 <strong>分子动力学模拟引擎：</strong>2016.2-dev-20170105-4feb0be <strong>力场：</strong>charmm36 <strong>温度：</strong>310 K <strong>压力：</strong>1 巴 <strong>模拟时长：</strong>2940 纳秒（ns） <strong>数据保存频率：</strong>100 皮秒（ps） <strong>分子组成：</strong><br> 携带D202A突变的LAPTM4B-TM3肽段（TM3_D2A）：10<br> 1-棕榈酰-2-油酰-sn-甘油-3-磷酸胆碱（POPC）：512<br> 神经酰胺16:0（CER160）：50<br> 水分子（SOL）：28090<br> 钠离子（NA）：75<br> 氯离子（CL）：75 <strong>补充信息：</strong><br> * 包含携带D202A突变的LAPTM4B TM3肽段的膜体系。
