SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus Deutschland

Für die Planung von Maßnahmen zur Eindämmung von COVID-19 kommt der genauen Kenntnis der Eigenschaften von SARS-CoV-2 eine zentrale Bedeutung zu. Eine besondere Rolle spielen in diesem Zusammenhang Mutationen des Virus. Für eine erfolgreiche Eindämmung der Pandemie ist es daher entscheidend, einen detaillierten Überblick über die Ausbreitungsmuster spezifischer SARS-CoV-2-Mutationen zu erhalten und auch neue Mutation frühzeitig zu entdecken.<br>Hierfür stellt das Robert Koch-Institut die Systeme zur bundesweiten molekularen Surveillance bereit. Jedes Labor in Deutschland, das SARS-CoV-2 sequenziert, ist laut der Verordnung zur molekulargenetischen Surveillance des Coronavirus SARS-CoV-2 verpflichtet, dem Robert Koch-Institut die Sequenz- und zugehörige Metadaten zu übermitteln. Technisch erfolgt diese Übermittlung über den Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub (DESH).<br>Im Projekt "OSEDA - Offene Sequenzdaten" verpflichtet sich das RKI, die aufgearbeiteten und qualitätskontrollierten Sequenzdaten zusammen mit einer Auswahl von klinisch-epidemiologischen Daten über die öffentlich zugängliche Repositorien des European Nucleotide Archive) und GISAID für weitere Forschungsvorhaben bereitzustellen.在制定新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情防控措施时，精准掌握新型冠状病毒（SARS-CoV-2）的各项特性具有核心意义。在此背景下，病毒突变发挥着尤为关键的作用。因此，成功遏制本次新冠大流行的关键在于，全面掌握特定SARS-CoV-2突变株的传播模式，并能够及早发现新型突变。 为此，罗伯特·科赫研究所（Robert Koch-Institut）搭建了覆盖全德国的分子监测系统。根据《新型冠状病毒（SARS-CoV-2）分子遗传学监测条例》，德国境内所有完成SARS-CoV-2基因测序的实验室，均有义务向罗伯特·科赫研究所提交测序序列及相关元数据。此类数据提交的技术实现依托德国电子序列数据中心（Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub, DESH）。 在“OSEDA——开放序列数据”项目中，罗伯特·科赫研究所承诺，将经过整理与质量管控的测序序列数据，搭配精选的临床流行病学数据，通过欧洲核苷酸档案库（European Nucleotide Archive）及GISAID的公开可访问存储库，向后续科研工作开放共享。