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Metagenome assembled genomes co_7-Bin_8_1.fa

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Figshare2021-05-06 更新2026-04-08 收录
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资源简介:

Co-assemblies were binned with CONCOCT within anvi’o v5.1 by clustering scaffolds 2500 bp or longer into metagenome assembled genomes (MAGs) and manually refining them within the anvi’o platform. Furthermore, dRep v2.3.2 was used to dereplicate MAGs and obtain representative genomes with flags ‘-comp 50 -con 10’ and default values.

本研究中的共组装序列采用CONCOCT工具,在anvi’o v5.1平台内完成分箱操作:将长度不低于2500 bp的支架序列(scaffolds)聚类为宏基因组组装基因组(metagenome assembled genomes, MAGs),随后在anvi’o平台内对所得基因组进行人工精细化校正。此外,本研究使用dRep v2.3.2工具对MAGs进行去冗余处理,并获取代表性基因组,分析时采用的参数标识为'-comp 50 -con 10',其余参数均采用默认设置。

创建时间:
2021-05-06
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