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Metagenomics Binning And Annotation Dataset Of Elkhorn Slough Microbial Mats

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Zenodo2020-09-18 更新2026-05-25 收录
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资源简介:

Supplemental sequencing and annotation data for metagenomics binning and annotation dataset of Elkhorn Slough microbial mats. Mats.Combined.Annotations.IP.GN.RS.IMG.PA.SE.KO.zip : Zipped annotation file of MG-RAST annotations from 3 combined metagenomic binning datasets. Annotations are pulled from Interpro, GenBank, RefSeq, IMG, PATRIC, SEED, and KEGG. k63.seq.zip : Scaffold and Prodigal called ORFs of the k63 co-assembly k45.seq.zip : Scaffold and Prodigal called ORFs of the k45 co-assembly k29.seq.zip : Scaffold and Prodigal called ORFs of the k29 co-assembly

本数据集为埃尔克霍恩斯卢格(Elkhorn Slough)微生物垫(microbial mats)宏基因组分箱(metagenomics binning)与注释数据集的补充测序及注释数据。 Mats.Combined.Annotations.IP.GN.RS.IMG.PA.SE.KO.zip:该压缩文件集成了3个合并宏基因组分箱数据集的MG-RAST注释结果,其注释信息来源于Interpro、GenBank、RefSeq、IMG、PATRIC、SEED及KEGG数据库。 k63.seq.zip:包含k63联合组装的支架序列与Prodigal预测得到的开放阅读框(Open Reading Frame, ORFs)数据。 k45.seq.zip:包含k45联合组装的支架序列与Prodigal预测得到的开放阅读框数据。 k29.seq.zip:包含k29联合组装的支架序列与Prodigal预测得到的开放阅读框数据。

提供机构:
Zenodo
创建时间:
2017-05-29
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