Ribo-seq data

Name: Ribo-seq data
Creator: figshare
Published: 2022-03-07 15:26:24
License: 暂无描述

DataCite Commons2022-03-07 更新2024-07-29 收录

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Processed ribo-seq data from several public datasets, in bigwig format. List of dataset is as follow:<br>├── Bazin_2017/│ ├── Bazin_wt_R1.bw│ └── Bazin_wt_R2.bw├── Hsu_2016/│ ├── Hsu_root_A.bw│ ├── Hsu_root_B.bw│ ├── Hsu_root_C.bw│ ├── Hsu_root_D.bw│ ├── Hsu_shoot_A.bw│ ├── Hsu_shoot_B.bw│ ├── Hsu_shoot_C.bw│ └── Hsu_shoot_D.bw├── Merchante_2017/│ ├── Mer_air_R1.bw│ ├── Mer_air_R2.bw│ ├── Mer_air_tot1.bw│ ├── Mer_air_tot2.bw│ ├── Mer_ethylene_R1.bw│ ├── Mer_ethylene_R2.bw│ ├── Mer_ethylene_tot1.bw│ └── Mer_ethylene_tot2.bw├── Xu_2017/│ ├── Xu_elf18_R1.bw│ ├── Xu_elf18_R2.bw│ ├── Xu_mock_R1.bw│ └── Xu_mock_R2.bw├── Yoo_2020/│ ├── Yoo_AvrRpt2_R1.bw│ ├── Yoo_AvrRpt2_R2.bw│ ├── Yoo_AvrRpt2_R3.bw│ ├── Yoo_mock_R1.bw│ ├── Yoo_mock_R2.bw│ └── Yoo_mock_R3.bw└── Zypfel_2021/ ├── R1_flg22_00.bw ├── R1_flg22_05.bw ├── R1_flg22_10.bw ├── R1_flg22_30.bw ├── R1_flg22_90.bw ├── R1_mock_00.bw ├── R1_mock_05.bw ├── R1_mock_10.bw ├── R1_mock_30.bw ├── R1_mock_90.bw ├── R2_flg22_00.bw ├── R2_flg22_05.bw ├── R2_flg22_10.bw ├── R2_flg22_30.bw ├── R2_flg22_90.bw ├── R2_mock_00.bw ├── R2_mock_05.bw ├── R2_mock_10.bw ├── R2_mock_30.bw ├── R2_mock_90.bw ├── R3_flg22_00.bw ├── R3_flg22_05.bw ├── R3_flg22_10.bw ├── R3_flg22_30.bw ├── R3_flg22_90.bw ├── R3_mock_00.bw ├── R3_mock_05.bw ├── R3_mock_10.bw ├── R3_mock_30.bw ├── R3_mock_90.bw ├── R4_flg22_00.bw ├── R4_flg22_05.bw ├── R4_flg22_10.bw ├── R4_flg22_30.bw ├── R4_flg22_90.bw ├── R4_mock_00.bw ├── R4_mock_05.bw ├── R4_mock_10.bw ├── R4_mock_30.bw └── R4_mock_90.bw

本数据集涵盖多份公开数据集来源的经预处理的核糖体测序（ribo-seq）数据，文件格式为bigwig。数据集列表如下： ├── Bazin_2017/ │ ├── Bazin_wt_R1.bw │ └── Bazin_wt_R2.bw ├── Hsu_2016/ │ ├── Hsu_root_A.bw │ ├── Hsu_root_B.bw │ ├── Hsu_root_C.bw │ ├── Hsu_root_D.bw │ ├── Hsu_shoot_A.bw │ ├── Hsu_shoot_B.bw │ ├── Hsu_shoot_C.bw │ └── Hsu_shoot_D.bw ├── Merchante_2017/ │ ├── Mer_air_R1.bw │ ├── Mer_air_R2.bw │ ├── Mer_air_tot1.bw │ ├── Mer_air_tot2.bw │ ├── Mer_ethylene_R1.bw │ ├── Mer_ethylene_R2.bw │ ├── Mer_ethylene_tot1.bw │ └── Mer_ethylene_tot2.bw ├── Xu_2017/ │ ├── Xu_elf18_R1.bw │ ├── Xu_elf18_R2.bw │ ├── Xu_mock_R1.bw │ └── Xu_mock_R2.bw ├── Yoo_2020/ │ ├── Yoo_AvrRpt2_R1.bw │ ├── Yoo_AvrRpt2_R2.bw │ ├── Yoo_AvrRpt2_R3.bw │ ├── Yoo_mock_R1.bw │ ├── Yoo_mock_R2.bw │ └── Yoo_mock_R3.bw └── Zypfel_2021/ ├── R1_flg22_00.bw ├── R1_flg22_05.bw ├── R1_flg22_10.bw ├── R1_flg22_30.bw ├── R1_flg22_90.bw ├── R1_mock_00.bw ├── R1_mock_05.bw ├── R1_mock_10.bw ├── R1_mock_30.bw ├── R1_mock_90.bw ├── R2_flg22_00.bw ├── R2_flg22_05.bw ├── R2_flg22_10.bw ├── R2_flg22_30.bw ├── R2_flg22_90.bw ├── R2_mock_00.bw ├── R2_mock_05.bw ├── R2_mock_10.bw ├── R2_mock_30.bw ├── R2_mock_90.bw ├── R3_flg22_00.bw ├── R3_flg22_05.bw ├── R3_flg22_10.bw ├── R3_flg22_30.bw ├── R3_flg22_90.bw ├── R3_mock_00.bw ├── R3_mock_05.bw ├── R3_mock_10.bw ├── R3_mock_30.bw ├── R3_mock_90.bw ├── R4_flg22_00.bw ├── R4_flg22_05.bw ├── R4_flg22_10.bw ├── R4_flg22_30.bw ├── R4_flg22_90.bw ├── R4_mock_00.bw ├── R4_mock_05.bw ├── R4_mock_10.bw ├── R4_mock_30.bw └── R4_mock_90.bw

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2022-03-07