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PHY_BI_con_tree_MrBayes

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DataONE2014-04-15 更新2024-06-27 收录
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The 50% majority consensus tree from MrBayes run (25% of the total generations were discarded as burn-in), based on "PHY_alignment.fas" (translated into amino acids). The analysis was carried out with two independent MCMC runs, four chains each, trees sampled every 1000 generations and JTT + F model. Alphanumeric codes following species names are the four-letter 1KP transcriptome identifiers, Genbank accessions or both.

本数据集为基于翻译为氨基酸序列的"PHY_alignment.fas"比对文件,经MrBayes分析得到的50%多数一致性树(分析过程中舍弃总世代数的25%作为烧失期(burn-in)样本)。本次分析设置两次独立的马尔可夫链蒙特卡洛(Markov Chain Monte Carlo, MCMC)运行,每条运行包含四条马尔可夫链,每1000个世代采样一次系统发育树,并采用JTT+F进化模型。物种名称后的字母数字编码为四位字母的1KP转录组标识符、GenBank登录号,或两者兼具。
创建时间:
2014-04-15
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