Profile-HMMs

profile-hmms.tar.gz contains the profile hidden Markov models used in this work. cld.hmm - All Cld proteins cld1.hmm - Lineage 1 Cld cld2.hmm - Lineage 2 Cld PF00174.hmm - Pfam 00174 PF00384.hmm - Pfam 00384 PF00384_PCRA.hmm - A Pfam 00384 subfamily with reductase acitivityprofile-hmms.tar.gz 包含本研究中使用的隐马尔可夫轮廓模型（profile hidden Markov models）。 cld.hmm：涵盖所有Cld蛋白 cld1.hmm：对应谱系1型Cld蛋白 cld2.hmm：对应谱系2型Cld蛋白 PF00174.hmm：对应Pfam家族00174 PF00384.hmm：对应Pfam家族00384 PF00384_PCRA.hmm：Pfam 00384家族的一个具有还原酶活性的亚家族