MOESM2 of The core populations and co-occurrence patterns of prokaryotic communities in household biogas digesters

Additional file 2: Table S1. Prokaryotic diversity indices based on 97 % identity of 16S rRNA gene sequences and 2230 reads per sample. Table S2. The relative contributions (R square value) of each environmental factor to OTUs in all samples, Cluster I and II based on RDA analysis. Table S3. Relative abundances of core genera/OTUs in all 43 samples and sub-core genera/OTUs in Cluster I and II, and their correlation to environmental factors. Table S4. Relative abundances of the abundant phyla (average relative abundance >0.1%) and genera (average relative abundance >0.05 %). Table S5. Pearson’s correlation of abundant phyla and genera to environmental factors in Cluster I and II. Table S6. Pearson’s correlation of abundant methanogens to environmental factors in all samples. Table S7. Topological properties of co-occurring networks AS (43 samples), C1 (27 samples in Cluster I), and C2 (16 samples in Cluster II), generated with Gephi software. Table S8. Node information of 103 cosmopolitan OTUs in the network C1 (Cluster I). Table S9. Positive and negative interactions among modules in network AS, C1, and C2. Table S10. Node information of 206 cosmopolitan OTUs in the network C2 (Cluster II). Table S11. Node information of 110 cosmopolitan OTUs in the network AS (all samples). Table S12. Fermentation conditions and chemical properties in biogas digesters.

附加文件2：表S1。基于16S rRNA基因序列97%同源性阈值及每个样本2230条读长序列的原核生物多样性指数。
表S2。基于冗余分析（RDA, Redundancy Analysis），各环境因子对全部样本、聚类组I与聚类组II中操作分类单元（OTU, Operational Taxonomic Unit）的相对贡献（决定系数R²值）。
表S3。全部43个样本中的核心属/OTU相对丰度，以及聚类组I与聚类组II中的亚核心属/OTU相对丰度，及其与环境因子的相关性。
表S4。优势类群的相对丰度：包括平均相对丰度>0.1%的菌门，以及平均相对丰度>0.05%的菌属。
表S5。聚类组I与聚类组II中，优势菌门和优势菌属与环境因子的皮尔逊（Pearson）相关性分析结果。
表S6。全部样本中，优势产甲烷菌与环境因子的皮尔逊相关性分析结果。
表S7。采用Gephi软件构建的共现网络拓扑属性，分别对应全样本组AS（43个样本）、聚类组I（27个样本）与聚类组II（16个样本）。
表S8。聚类组I网络C1中103个广布OTU的节点信息。
表S9。全样本网络AS、聚类组I网络C1与聚类组II网络C2中各模块间的正向与负向互作关系。
表S10。聚类组II网络C2中206个广布OTU的节点信息。
表S11。全样本网络AS中110个广布OTU的节点信息。
表S12。沼气发酵罐的发酵条件与理化性质。