scIBD website data

Data files used in scIBD (www.scibd.cn) is also available here. Gene expression matrix Integrated gene expression matrix of scIBD (Anndata object in H5AD format) (scIBD.gex_matrix.h5ad) Integrated gene expression matrix of scIBD (Seurat object in RDS format) (scIBD.gex_matrix.rds) Meta data of scIBD (scIBD_sample_meta_data.txt.gz) Differential expressed genes Differential expressed genes across cell subtypes within each major cluster (scIBD.deg_by_major_cluster.rds) Differential activated regulons Differential regulons between healthy and disease in each major cluster (scIBD.diff_regulon_by_major_cluster.rds)scIBD（www.scibd.cn）所使用的数据集文件亦可在此处获取。具体包含以下数据： 1. 基因表达矩阵： - scIBD整合基因表达矩阵（H5AD格式的Anndata对象），文件名为scIBD.gex_matrix.h5ad； - scIBD整合基因表达矩阵（RDS格式的Seurat对象），文件名为scIBD.gex_matrix.rds。 2. scIBD元数据：scIBD_sample_meta_data.txt.gz。 3. 差异表达基因：各主要聚类内不同细胞亚型间的差异表达基因，对应文件为scIBD.deg_by_major_cluster.rds。 4. 差异激活调控子：各主要聚类中健康组与疾病组间的差异激活调控子，对应文件为scIBD.diff_regulon_by_major_cluster.rds。