SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus Deutschland

Für die Planung von Maßnahmen zur Eindämmung von COVID-19 kommt der genauen Kenntnis der Eigenschaften von SARS-CoV-2 eine zentrale Bedeutung zu. Eine besondere Rolle spielen in diesem Zusammenhang Mutationen des Virus. Für eine erfolgreiche Eindämmung der Pandemie ist es daher entscheidend, einen detaillierten Überblick über die Ausbreitungsmuster spezifischer SARS-CoV-2-Mutationen zu erhalten und auch neue Mutation frühzeitig zu entdecken.<br>Hierfür stellt das Robert Koch-Institut die Systeme zur bundesweiten molekularen Surveillance bereit. Jedes Labor in Deutschland, das SARS-CoV-2 sequenziert, ist laut der Verordnung zur molekulargenetischen Surveillance des Coronavirus SARS-CoV-2 verpflichtet, dem Robert Koch-Institut die Sequenz- und zugehörige Metadaten zu übermitteln. Technisch erfolgt diese Übermittlung über den Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub (DESH).<br>Im Projekt "OSEDA - Offene Sequenzdaten" verpflichtet sich das RKI, die aufgearbeiteten und qualitätskontrollierten Sequenzdaten zusammen mit einer Auswahl von klinisch-epidemiologischen Daten über die öffentlich zugängliche Repositorien des European Nucleotide Archive) und GISAID für weitere Forschungsvorhaben bereitzustellen.为规划新冠病毒（SARS-CoV-2）感染的防控措施，精准掌握该病毒的各项特性具有核心意义。在此背景下，病毒突变发挥着尤为关键的作用。因此，成功遏制新冠大流行的关键在于，全面掌握特定SARS-CoV-2突变株的传播模式，并及早发现新型突变。 为此，罗伯特·科赫研究所（Robert Koch-Institut, RKI）搭建了覆盖全德国的分子监测系统。根据《新冠病毒SARS-CoV-2分子遗传监测条例》，德国境内所有完成SARS-CoV-2基因测序的实验室，均有义务向罗伯特·科赫研究所提交测序数据及相关元数据。该数据提交流程依托德国电子序列数据中心（Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub, DESH）完成技术实现。 在"OSEDA - 开放序列数据"项目框架下，罗伯特·科赫研究所承诺，将经过整理与质量管控的测序数据，结合筛选后的临床流行病学数据，通过欧洲核苷酸档案馆（European Nucleotide Archive）与全球流感共享数据库（GISAID）这两个公开存储库，对外发布以供后续科研活动使用。