Eelgrass SNPs

Genotyping by re-sequencing 41 eelgrass samples from Norway (10 a 4 samples, locations from Ålesund - Halden). Variants called by FreeBayes, quality > 30, minimum depth 8, maximum depth 60, if genotype <8 set to missing, maximum 10% missing genotypes, SNPs in Hardy-Wineberg dis. <1e-3 removed.对采自挪威的41份鳗草样本开展重测序基因分型（包含10组各4份样本，采样范围覆盖奥勒松至哈尔登）。采用FreeBayes进行变异位点检出，设置如下过滤参数：变异质量值大于30，最小测序深度为8，最大测序深度为60；当基因型对应的测序深度小于8时，将该基因型标记为缺失；缺失基因型的最大占比不得超过10%；哈迪-温伯格不平衡检验中P值小于1×10^-3的单核苷酸多态性（SNPs）将被移除。