Additional file 1 of 3D chromatin-based variant-to-gene maps across 57 human cell types reveal the cellular and genetic architecture of autoimmune disease susceptibility

Additional file 1. Spreadsheets of Supplementary Tables S1-S13. Table S1. Data resources of 57 cell types. Table S2. 16 autoimmune disorders. Table S3. Details of 4 cell type-specific eQTL databases. Table S4. Full LDSC analysis result. Table S5. Full variant-to-gene mapping result. Table S6. Full KEGG pathway enrichment analysis result. Table S7. Full GO-term enrichment analysis result. Table S8. Details of 258 loci used for eQTL analysis. Table S9. Shared cell types and trait specific eGenes between eQTLs datasets and V2G. Table S10. High PP.H4.abf colocalization results with coloc.abf. Table S11. High PP.H3.abf colocalization hits results with coloc.susie. Table S12. Colocalization analysis of FDFT1 on locus chr8:9921161-11972641. Table S13. Immune cells donors and mAbs details附加文件1：补充表S1~S13的电子表格。 表S1：57种细胞类型的数据集资源。 表S2：16种自身免疫性疾病。 表S3：4个细胞类型特异性表达数量性状基因座（expression Quantitative Trait Loci, eQTL）数据库详情。 表S4：完整连锁不平衡得分回归（Linkage Disequilibrium Score Regression, LDSC）分析结果。 表S5：完整变异-基因映射（variant-to-gene mapping, V2G）分析结果。 表S6：完整京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG）通路富集分析结果。 表S7：完整基因本体术语（Gene Ontology term, GO-term）富集分析结果。 表S8：用于eQTL分析的258个基因座详情。 表S9：eQTL数据集与V2G间共有的细胞类型及性状特异性e基因（eGenes）。 表S10：基于coloc.abf的高PP.H4.abf共定位分析结果。 表S11：基于coloc.susie的高PP.H3.abf共定位命中结果。 表S12：FDFT1基因在chr8:9921161-11972641基因座的共定位分析。 表S13：免疫细胞供体与单克隆抗体（monoclonal antibodies, mAbs）详情。